seq1 = pF1KB8328.tfa, 519 bp
seq2 = pF1KB8328/gi568815575f_153694688.tfa (gi568815575f:153694688_153898430), 203743 bp

>pF1KB8328 519
>gi568815575f:153694688_153898430 (ChrX)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-186  (101747-101865)   100% ->
187-261  (102771-102845)   100% ->
262-351  (103038-103127)   100% ->
352-417  (103384-103449)   100% ->
418-519  (103642-103743)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGATGGCATCTCTCGGCGCCCTGGCGCTGCTCCTGCTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGATGGCATCTCTCGGCGCCCTGGCGCTGCTCCTGCTGTCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTCCCGCTGCTCAG         CCGAGGCCTGCCTGGAGCCCCAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTCCCGCTGCTCAGGTA...CAGCCGAGGCCTGCCTGGAGCCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCACCCCTTCCTACTACACCACTTCTGACGCTGTCATTTCCACTGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 TCACCCCTTCCTACTACACCACTTCTGACGCTGTCATTTCCACTGAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCTTCATTGTGGAGATCTCCCTGACATGCAAGAACAGGGTCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101821 GTCTTCATTGTGGAGATCTCCCTGACATGCAAGAACAGGGTCCAGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     AACATGGCTCTCTATGCTGACGTCGGTGGAAAACAATTCCCTGTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101871 .CAGAACATGGCTCTCTATGCTGACGTCGGTGGAAAACAATTCCCTGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCGAGGCCAGGATGTGGGGCGTTATCAG         GTGTCCTGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102817 CTCGAGGCCAGGATGTGGGGCGTTATCAGGTG...CAGGTGTCCTGGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGACCACAAGAGCGCCCACGCAGGCACCTATGAGGTTAGATTCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103050 CTGGACCACAAGAGCGCCCACGCAGGCACCTATGAGGTTAGATTCTTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGAGGAGTCCTACAGCCTCCTCAGGAAG         GCTCAGAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103100 CGAGGAGTCCTACAGCCTCCTCAGGAAGGTG...CAGGCTCAGAGGAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACGAGGACATTTCCATCATCCCGCCTCTGTTTACAGTCAGCGTGGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103397 ACGAGGACATTTCCATCATCCCGCCTCTGTTTACAGTCAGCGTGGACCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CGG         GGCACTTGGAACGGGCCCTGGGTGTCCACTGAGGTGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103447 CGGGTG...CAGGGCACTTGGAACGGGCCCTGGGTGTCCACTGAGGTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGCTGCGGCGATCGGCCTTGTGATCTACTACTTGGCCTTCAGTGCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103680 GGCTGCGGCGATCGGCCTTGTGATCTACTACTTGGCCTTCAGTGCGAAGA

    550     .    :
    506 GCCACATCCAGGCC
        ||||||||||||||
 103730 GCCACATCCAGGCC