seq1 = pF1KB8322.tfa, 2004 bp
seq2 = pF1KB8322/gi568815595r_114239008.tfa (gi568815595r:114239008_114451858), 212851 bp

>pF1KB8322 2004
>gi568815595r:114239008_114451858 (Chr3)

(complement)

1-1585  (100001-101585)   100% ->
1586-2004  (112433-112851)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAACCGTGGCCACTTCTGTGACGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCGAGACCCTCAACGAGCAGCGCAACCGTGGCCACTTCTGTGACGTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACCGCTGCGTGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACCGCTGCGTGCTGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGATCCCGTCGGTGGTGTCAGTGCAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGATCCCGTCGGTGGTGTCAGTGCAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTCGGAAGCTCTGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTCGGAAGCTCTGCAGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCATCGTGTCACAGAACGTGGGCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCATCGTGTCACAGAACGTGGGCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAGTCAGGCACGTCAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAGTCAGGCACGTCAGGCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGACAGGATCTACTCGGCACTCTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGACAGGATCTACTCGGCACTCTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGGTCAGCCACCACGAGACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGGTCAGCCACCACGAGACTGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCCATGAGCGCTCGCAGCAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCCATGAGCGCTCGCAGCAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGCATCCAGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCGGCCTGTGCGCATCCAGACCCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGGCAGCAAAGGGTGCAGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGGGCAGCAAAGGGTGCAGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGCACCGAGAGTGAGCCCAAAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGCACCGAGAGTGAGCCCAAAGGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGCAGCAGTTTGGGCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGCAGCAGTTTGGGCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAGCCCCCGCTGAGGGTGGTCCGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAGCCCCCGCTGAGGGTGGTCCGCAGACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATGGACAGCACTGTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATGGACAGCACTGTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TACAACAGCCTTCGGTCAACACGTCCATCGGGCAGCCATTGCCAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TACAACAGCCTTCGGTCAACACGTCCATCGGGCAGCCATTGCCAAGTACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGGATGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCTGACCTTGACCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCTGACCTTGACCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAGCCCGCGGGCAGTGGCCCCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCTGCCAGCCCTCTTCACTACCCAGCCCGCGGGCAGTGGCCCCAAGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCCAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCCAGTTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GACAGTGTCCCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GACAGTGTCCCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CACAGCCCCTGGCCTCATCCGCAGGCCACAGCACAGCCAGTGGGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CACAGCCCCTGGCCTCATCCGCAGGCCACAGCACAGCCAGTGGGCAAGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTTCACCGCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ACAGAACTACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAG         GTGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101551 ACAGAACTACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAGGTG...CAGGTGAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGCCCCACCAATGCAGCATCTGTTGGCGCTCCTTCTCCTTAAAGGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112439 AGCCCCACCAATGCAGCATCTGTTGGCGCTCCTTCTCCTTAAAGGATTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112489 CTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGTAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 TATCTGCAACAAGCGCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112539 TATCTGCAACAAGCGCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GCCTCCACCGGGGAGAGAAGTCCTACGAGTGCTACATCTGCAAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112589 GCCTCCACCGGGGAGAGAAGTCCTACGAGTGCTACATCTGCAAAAAGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 TTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112639 TTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTGCCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 CAATGGGACCCCCCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112689 CAATGGGACCCCCCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CAGGCGTGGTGGCCTGCACGGAGGGGACCACTTACGTCTGCTCCGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112739 CAGGCGTGGTGGCCTGCACGGAGGGGACCACTTACGTCTGCTCCGTCTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 CCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112789 CCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAGGATGCA

   2000     .    :
   1992 TGTGTCTGACGGA
        |||||||||||||
 112839 TGTGTCTGACGGA