seq1 = pF1KB8319.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KB8319/gi568815582r_57329173.tfa (gi568815582r:57329173_57540928), 211756 bp

>pF1KB8319 897
>gi568815582r:57329173_57540928 (Chr16)

(complement)

1-157  (100001-100157)   100% ->
158-271  (101634-101747)   100% ->
272-348  (104197-104273)   100% ->
349-517  (106717-106885)   99% ->
518-591  (108369-108442)   100% ->
592-707  (109663-109778)   100% ->
708-789  (110590-110671)   100% ->
790-897  (111649-111756)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGATTTTGGGATCTCTGCTGGCCAGTTTGTGGCAGTGGTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGATTTTGGGATCTCTGCTGGCCAGTTTGTGGCAGTGGTCTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAGTCATCCCCAGTGGAGGCTCTGAAAGGTCTGGTGGATAAGCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAGTCATCCCCAGTGGAGGCTCTGAAAGGTCTGGTGGATAAGCTTCAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTTAACCGGCAATGAGGGCCGCGTGTCTGTGGAAAACATCAAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTTAACCGGCAATGAGGGCCGCGTGTCTGTGGAAAACATCAAGCAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCAAT         GTTTAGTCCCAGGAAGCACCACTCTGCACAGTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGCAATGTA...CAGGTTTAGTCCCAGGAAGCACCACTCTGCACAGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGATTTTGGCTGAAATCGCCCGGATCCTTCGGCCTGGTGGATGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101668 TGAGATTTTGGCTGAAATCGCCCGGATCCTTCGGCCTGGTGGATGTCTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCTGAAGGAGCCAGTAGAGACAGCTGTAG         ATAACAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101718 TTCTGAAGGAGCCAGTAGAGACAGCTGTAGGTA...CAGATAACAATAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGTGAAGACAGCATCTAAGCTGTGTTCAGCCCTGACTCTTTCTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104208 AAAGTGAAGACAGCATCTAAGCTGTGTTCAGCCCTGACTCTTTCTGGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGGAAGTGAAAGAG         CTGCAGCGGGAGCCCCTAACCCCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104258 TGTGGAAGTGAAAGAGGTA...TAGCTGCAGCGGGAGCCCCTAACCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAAGTACAGTTTGTTCGAGAACACCTTGGTCATGAAAGTGACAACCTG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106742 AGGAAGTACAGTCTGTTCGAGAACACCTTGGTCATGAAAGTGACAACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGTTTGTTCAGATCACAGGCAAAAAACCAAACTTTGAAGTGGGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106792 CTGTTTGTTCAGATCACAGGCAAAAAACCAAACTTTGAAGTGGGTTCTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAGGCAGCTTAAGCTTTCCATCACCAAGAAGTCTTCTCCTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106842 TAGGCAGCTTAAGCTTTCCATCACCAAGAAGTCTTCTCCTTCAGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    518    TGAAACCTGCTGTGGACCCTGCTGCTGCCAAGCTGTGGACCCTCTCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108366 CAGTGAAACCTGCTGTGGACCCTGCTGCTGCCAAGCTGTGGACCCTCTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCAACGATATGGAGGACGACAGCATG         GATCTCATTGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108416 GCCAACGATATGGAGGACGACAGCATGGTG...CAGGATCTCATTGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGATGAGCTGCTGGATCCAGAAGATTTGAAGAAGCCAGATCCAGCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109677 AGATGAGCTGCTGGATCCAGAAGATTTGAAGAAGCCAGATCCAGCTTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCGGGCTGCTTCTTGTGGGGAAGGGAAAAAGAGGAAGGCCTGTAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109727 TGCGGGCTGCTTCTTGTGGGGAAGGGAAAAAGAGGAAGGCCTGTAAGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TG         CACCTGTGGCCTTGCCGAAGAACTGGAAAAAGAGAAGTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109777 TGGTG...CAGCACCTGTGGCCTTGCCGAAGAACTGGAAAAAGAGAAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAGGGAACAGATGAGCTCCCAACCCAAGTCAGCTTGTGGAAAC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110629 AAGGGAACAGATGAGCTCCCAACCCAAGTCAGCTTGTGGAAACGTA...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    790   TGCTACCTGGGCGATGCCTTCCGCTGTGCCAGCTGCACCTACCTTGGG
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 111647 AGTGCTACCTGGGCGATGCCTTCCGCTGTGCCAGCTGCCCCTACCTTGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATGCCAGCCTTCAAACCTGGGGAAAAGGTGCTTCTGAGTGATAGCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111697 ATGCCAGCCTTCAAACCTGGGGAAAAGGTGCTTCTGAGTGATAGCAATCT

    950     .    :
    888 TAATGATGCC
        | ||||||||
 111747 TCATGATGCC