seq1 = pF1KB8317.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KB8317/gi568815575r_153930370.tfa (gi568815575r:153930370_154132561), 202192 bp

>pF1KB8317 1458
>gi568815575r:153930370_154132561 (ChrX)

(complement)

1-26  (40353-40378)   100% ->
27-377  (100005-100355)   100% ->
378-1458  (101112-102192)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTAGCTGGGATGTTAGGGCTCAG         GGAAGAAAAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  40353 ATGGTAGCTGGGATGTTAGGGCTCAGGTA...CAGGGAAGAAAAGTCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGACCAGGACCTCCAGGGCCTCAAGGACAAACCCCTCAAGTTTAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 AGACCAGGACCTCCAGGGCCTCAAGGACAAACCCCTCAAGTTTAAAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAGAAAGATAAGAAAGAAGAGAAAGAGGGCAAGCATGAGCCCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 TGAAGAAAGATAAGAAAGAAGAGAAAGAGGGCAAGCATGAGCCCGTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCATCAGCCCACCACTCTGCTGAGCCCGCAGAGGCAGGCAAAGCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100120 CCATCAGCCCACCACTCTGCTGAGCCCGCAGAGGCAGGCAAAGCAGAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCAGAAGGGTCAGGCTCCGCCCCGGCTGTGCCGGAAGCTTCTGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 ATCAGAAGGGTCAGGCTCCGCCCCGGCTGTGCCGGAAGCTTCTGCCTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAAACAGCGGCGCTCCATCATCCGTGACCGGGGACCCATGTATGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100220 CCAAACAGCGGCGCTCCATCATCCGTGACCGGGGACCCATGTATGATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCACCCTGCCTGAAGGCTGGACACGGAAGCTTAAGCAAAGGAAATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100270 CCCACCCTGCCTGAAGGCTGGACACGGAAGCTTAAGCAAAGGAAATCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGCTCTGCTGGGAAGTATGATGTGTATTTGATCAA         TCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100320 CCGCTCTGCTGGGAAGTATGATGTGTATTTGATCAAGTA...CAGTCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGGAAAAGCCTTTCGCTCTAAAGTGGAGTTGATTGCGTACTTCGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101117 AGGGAAAAGCCTTTCGCTCTAAAGTGGAGTTGATTGCGTACTTCGAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTAGGCGACACATCCCTGGACCCTAATGATTTTGACTTCACGGTAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101167 GTAGGCGACACATCCCTGGACCCTAATGATTTTGACTTCACGGTAACTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGAGGGAGCCCCTCCCGGCGAGAGCAGAAACCACCTAAGAAGCCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101217 GAGAGGGAGCCCCTCCCGGCGAGAGCAGAAACCACCTAAGAAGCCCAAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCCCAAAGCTCCAGGAACTGGCAGAGGCCGGGGACGCCCCAAAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 CTCCCAAAGCTCCAGGAACTGGCAGAGGCCGGGGACGCCCCAAAGGGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCACCACGAGACCCAAGGCGGCCACGTCAGAGGGTGTGCAGGTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 GGCACCACGAGACCCAAGGCGGCCACGTCAGAGGGTGTGCAGGTGAAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGTCCTGGAGAAAAGTCCTGGGAAGCTCCTTGTCAAGATGCCTTTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101367 GGTCCTGGAGAAAAGTCCTGGGAAGCTCCTTGTCAAGATGCCTTTTCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTTCGCCAGGGGGCAAGGCTGAGGGGGGTGGGGCCACCACATCCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101417 CTTCGCCAGGGGGCAAGGCTGAGGGGGGTGGGGCCACCACATCCACCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GTCATGGTGATCAAACGCCCCGGCAGGAAGCGAAAAGCTGAGGCCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101467 GTCATGGTGATCAAACGCCCCGGCAGGAAGCGAAAAGCTGAGGCCGACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCAGGCCATTCCCAAGAAACGGGGCCGAAAGCCGGGGAGTGTGGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101517 TCAGGCCATTCCCAAGAAACGGGGCCGAAAGCCGGGGAGTGTGGTGGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCGCTGCCGCCGAGGCCAAAAAGAAAGCCGTGAAGGAGTCTTCTATCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101567 CCGCTGCCGCCGAGGCCAAAAAGAAAGCCGTGAAGGAGTCTTCTATCCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCTGTGCAGGAGACCGTACTCCCCATCAAGAAGCGCAAGACCCGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 TCTGTGCAGGAGACCGTACTCCCCATCAAGAAGCGCAAGACCCGGGAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGTCAGCATCGAGGTCAAGGAAGTGGTGAAGCCCCTGCTGGTGTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 GGTCAGCATCGAGGTCAAGGAAGTGGTGAAGCCCCTGCTGGTGTCCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCGGTGAGAAGAGCGGGAAAGGACTGAAGACCTGTAAGAGCCCTGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101717 TCGGTGAGAAGAGCGGGAAAGGACTGAAGACCTGTAAGAGCCCTGGGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAAAGCAAGGAGAGCAGCCCCAAGGGGCGCAGCAGCAGCGCCTCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101767 AAAAGCAAGGAGAGCAGCCCCAAGGGGCGCAGCAGCAGCGCCTCCTCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CCCCAAGAAGGAGCACCACCACCATCACCACCACTCAGAGTCCCCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101817 CCCCAAGAAGGAGCACCACCACCATCACCACCACTCAGAGTCCCCAAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCCCCGTGCCACTGCTCCCACCCCTGCCCCCACCTCCACCTGAGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101867 CCCCCGTGCCACTGCTCCCACCCCTGCCCCCACCTCCACCTGAGCCCGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AGCTCCGAGGACCCCACCAGCCCCCCTGAGCCCCAGGACTTGAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101917 AGCTCCGAGGACCCCACCAGCCCCCCTGAGCCCCAGGACTTGAGCAGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CGTCTGCAAAGAGGAGAAGATGCCCAGAGGAGGCTCACTGGAGAGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101967 CGTCTGCAAAGAGGAGAAGATGCCCAGAGGAGGCTCACTGGAGAGCGACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GCTGCCCCAAGGAGCCAGCTAAGACTCAGCCCGCGGTTGCCACCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102017 GCTGCCCCAAGGAGCCAGCTAAGACTCAGCCCGCGGTTGCCACCGCCGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ACGGCCGCAGAAAAGTACAAACACCGAGGGGAGGGAGAGCGCAAAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102067 ACGGCCGCAGAAAAGTACAAACACCGAGGGGAGGGAGAGCGCAAAGACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGTTTCATCCTCCATGCCAAGGCCAAACAGAGAGGAGCCTGTGGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102117 TGTTTCATCCTCCATGCCAAGGCCAAACAGAGAGGAGCCTGTGGACAGCC

   1450     .    :    .    :    .
   1433 GGACGCCCGTGACCGAGAGAGTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||
 102167 GGACGCCCGTGACCGAGAGAGTTAGC