seq1 = pF1KB8312.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KB8312/gi568815581f_78114317.tfa (gi568815581f:78114317_78323551), 209235 bp

>pF1KB8312 426
>gi568815581f:78114317_78323551 (Chr17)

1-111  (100001-100111)   100% ->
112-221  (100364-100473)   100% ->
222-339  (102348-102465)   100% ->
340-426  (109149-109235)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGCCCCGACGTTGCCCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGCCCCGACGTTGCCCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCGGAGCGG         ATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCGGAGCGGGTG...CAGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100394 ACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCAT         AGAGGAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100444 GGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATGTA...TAGAGAGGAACATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102359 AAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102409 GAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAATT         GCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102459 CAAAATTGTA...CAGGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAAACTGCGAAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109183 AGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATG

    450 
    424 GAT
        |||
 109233 GAT