seq1 = pF1KB8311.tfa, 351 bp
seq2 = pF1KB8311/gi568815582f_75466851.tfa (gi568815582f:75466851_75677366), 210516 bp

>pF1KB8311 351
>gi568815582f:75466851_75677366 (Chr16)

1-34  (99637-99670)   100% ->
35-90  (100002-100057)   100% ->
91-263  (101187-101359)   100% ->
264-351  (110429-110516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTGGATGTTCAAGGAGGACCACTCGCTGG         AACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99637 ATGAAGTGGATGTTCAAGGAGGACCACTCGCTGGGTA...CAGAACACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATGCGTGGAGTCCGCGAAGATTCGAGCGAAATATCCCGACAGGGTTCCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100009 ATGCGTGGAGTCCGCGAAGATTCGAGCGAAATATCCCGACAGGGTTCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91         GTGATTGTGGAAAAGGTCTCAGGCTCTCAGATTGTTGACATT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 TG...CAGGTGATTGTGGAAAAGGTCTCAGGCTCTCAGATTGTTGACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GACAAACGGAAGTACTTGGTTCCATCTGATATCACTGTGGCTCAGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101229 GACAAACGGAAGTACTTGGTTCCATCTGATATCACTGTGGCTCAGTTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGGATCATCAGGAAAAGGATCCAGCTTCCTTCTGAAAAGGCGATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101279 GTGGATCATCAGGAAAAGGATCCAGCTTCCTTCTGAAAAGGCGATCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTTTGTGGATAAGACAGTCCCACAGTCCAG         CCTAACTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101329 TGTTTGTGGATAAGACAGTCCCACAGTCCAGGTG...AAGCCTAACTATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGACAGCTTTACGAGAAGGAAAAAGATGAAGATGGATTCTTATATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110439 GGACAGCTTTACGAGAAGGAAAAAGATGAAGATGGATTCTTATATGTGGC

    350     .    :    .    :    .
    324 CTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 110489 CTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGCTTC