seq1 = pF1KB8307.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KB8307/gi568815591r_135829929.tfa (gi568815591r:135829929_136077100), 247172 bp

>pF1KB8307 354
>gi568815591r:135829929_136077100 (Chr7)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-186  (125471-125584)   100% ->
187-270  (126419-126502)   100% ->
271-354  (147089-147172)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCGACAAGGAGTTCATGTGGGCCCTGAAAAACGGAGACTTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCGACAAGGAGTTCATGTGGGCCCTGAAAAACGGAGACTTGGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGAAAGACTATGTGGCCAAG         GGAGAAGATGTCAACCGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 GGTGAAAGACTATGTGGCCAAGGTA...CAGGGAGAAGATGTCAACCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACTAGAAGGTGGAAGGAAACCTCTTCATTATGCAGCAGATTGTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125490 CACTAGAAGGTGGAAGGAAACCTCTTCATTATGCAGCAGATTGTGGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGAAATCCTGGAATTTCTGCTGCTGAAAGGAGCAGATATTAAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 125540 CTTGAAATCCTGGAATTTCTGCTGCTGAAAGGAGCAGATATTAATGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     GCTCCAGATAAACATCATATTACTCCTCTTCTGTCTGCTGTCTATG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125590 .TAGGCTCCAGATAAACATCATATTACTCCTCTTCTGTCTGCTGTCTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGGTCATGTTTCCTGTGTGAAATTGCTTCTGTCAAAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 126465 AGGGTCATGTTTCCTGTGTGAAATTGCTTCTGTCAAAGGTG...CAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCTGATAAGACTGTGAAAGGCCCAGATGGACTGACCGCCTTTGAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147092 GCTGATAAGACTGTGAAAGGCCCAGATGGACTGACCGCCTTTGAAGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :
    324 TGACAACCAGGCAATCAAAGCTCTTCTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 147142 TGACAACCAGGCAATCAAAGCTCTTCTCCAG