seq1 = pF1KB8302.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KB8302/gi568815588r_101727356.tfa (gi568815588r:101727356_101939840), 212485 bp

>pF1KB8302 675
>gi568815588r:101727356_101939840 (Chr10)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-213  (110642-110766)   99% ->
214-283  (111145-111214)   100% ->
284-354  (111382-111452)   100% ->
355-462  (111583-111690)   100% ->
463-557  (111848-111942)   100% ->
558-630  (112080-112152)   97% ->
631-675  (112441-112485)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCGATGCCCCCGCAGGTGCCGGAGCCCGCTGGGGCAGGCAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCGATGCCCCCGCAGGTGCCGGAGCCCGCTGGGGCAGGCAGCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCCTCTACCAGCTGGTGACTGGGTCGCTGTCCCCAG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 ATCCCTCTACCAGCTGGTGACTGGGTCGCTGTCCCCAGGTA...CAGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGTGGACGATGAATTTGAATCGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 110645 GCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110695 CTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGTACCGGGGCTTCAAGAAC         GAATGTCCCAGCGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110745 CCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGTG...CAGGAATGTCCCAGCGGAATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111164 TCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 G         ACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111214 GGTG...CAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAG         GACTTTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111422 CACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGTG...CAGGACTTTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111593 CTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111643 GCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    463        GAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111693 G...CAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111891 AGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AG         CTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGT
        ||>>>...>>>|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 111941 AGCTT...CACCTTCTTGCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GACCAATGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAG         GATGAGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 112119 GACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGTA...CAGGATGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .
    638 ACATCATGAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112448 ACATCATGAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC