seq1 = pF1KB8296.tfa, 1266 bp
seq2 = pF1KB8296/gi568815589r_133306956.tfa (gi568815589r:133306956_133517844), 210889 bp

>pF1KB8296 1266
>gi568815589r:133306956_133517844 (Chr9)

(complement)

1-225  (100001-100225)   100% ->
226-572  (102834-103180)   100% ->
573-716  (104924-105067)   100% ->
717-910  (105353-105546)   100% ->
911-999  (106772-106860)   100% ->
1000-1074  (109003-109077)   100% ->
1075-1149  (109964-110038)   100% ->
1150-1266  (110773-110889)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAGGCGAAGGTCCCCGCCTCCAAGCGCGCCCCGAGCAGCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAGGCGAAGGTCCCCGCCTCCAAGCGCGCCCCGAGCAGCCCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTAAGCCGGGTCCTGTCAAGACGCTCACTCGGAAGAAAAACAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTAAGCCGGGTCCTGTCAAGACGCTCACTCGGAAGAAAAACAAGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAAAAGGTTTTGGAAAAGCAAGGCGCGGGAAGTAAGCAAGAAGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAAAAGGTTTTGGAAAAGCAAGGCGCGGGAAGTAAGCAAGAAGCCAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGGCCCCGGTGCTGTGGTGCGACCTCCAAAGGCACCAGAAGACTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCGGCCCCGGTGCTGTGGTGCGACCTCCAAAGGCACCAGAAGACTTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAAAACTGGAAGGCGCTGCAAGAG         TGGCTGCTGAAACAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100201 TCAAAACTGGAAGGCGCTGCAAGAGGTG...CAGTGGCTGCTGAAACAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATCTCAGGCCCCAGAAAAGCCTCTTGTCATCTCTCAGATGGGTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 AATCTCAGGCCCCAGAAAAGCCTCTTGTCATCTCTCAGATGGGTTCCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGAAGCCCAAAATTATCCAGCAAAACAAAAAAGAGACCTCGCCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102900 AAGAAGCCCAAAATTATCCAGCAAAACAAAAAAGAGACCTCGCCTCAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGGGAGAGGAGATGCCGGCAGGAAAAGACCAGGAGGCCAGCAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102950 GAAGGGAGAGGAGATGCCGGCAGGAAAAGACCAGGAGGCCAGCAGGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGTTCCTTCAGGTTCCAAGATGGACAGGAGGGCGCCAGTACCTCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103000 CTGTTCCTTCAGGTTCCAAGATGGACAGGAGGGCGCCAGTACCTCGCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGGCCAGTGGAACAGAGCACAATAAGAAAGGAACCAAGGAAAGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103050 AAGGCCAGTGGAACAGAGCACAATAAGAAAGGAACCAAGGAAAGGACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGTGATATTGTTCCAGAACGAGGGGACATCGAGCATAAGAAGCGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103100 TGGTGATATTGTTCCAGAACGAGGGGACATCGAGCATAAGAAGCGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTAAGGAGGCAGCCCCAGCCCCACCCACCGA         GGAAGACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103150 CTAAGGAGGCAGCCCCAGCCCCACCCACCGAGTA...TAGGGAAGACATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGGTTTGACGACGTGGACCCAGCGGATATCGAAGCTGCCATAGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104934 TGGTTTGACGACGTGGACCCAGCGGATATCGAAGCTGCCATAGGTCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGCGGCCAAGATAGCGAGGAAACAGTTGGGTCAGAGCGAGGGCAGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104984 GGCGGCCAAGATAGCGAGGAAACAGTTGGGTCAGAGCGAGGGCAGCGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCCTCAGCCTCGTGAAAGAGCAGGCCTTCGGCGG         CCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105034 GCCTCAGCCTCGTGAAAGAGCAGGCCTTCGGCGGGTA...CAGCCTGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGAGCCTTAGCCTTGGACTGTGAGATGGTGGGCGTGGGCCCTAAGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105360 AGAGCCTTAGCCTTGGACTGTGAGATGGTGGGCGTGGGCCCTAAGGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGAGAGCATGGCCGCCCGTGTGTCCATCGTGAACCAGTATGGGAAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105410 GGAGAGCATGGCCGCCCGTGTGTCCATCGTGAACCAGTATGGGAAGTGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTTATGACAAGTACGTCAAACCAACCGAGCCCGTGACGGACTATAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105460 TTTATGACAAGTACGTCAAACCAACCGAGCCCGTGACGGACTATAGGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCGGTCAGTGGGATTCGGCCTGAGAACCTCAAGCAGG         GAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105510 GCGGTCAGTGGGATTCGGCCTGAGAACCTCAAGCAGGGTA...CAGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGAGCTTGAAGTTGTTCAGAAGGAAGTGGCAGAGATGCTGAAGGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106776 AGAGCTTGAAGTTGTTCAGAAGGAAGTGGCAGAGATGCTGAAGGGCAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TTCTAGTGGGGCACGCTCTGCATAATGACCTAAAG         GTACTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106826 TTCTAGTGGGGCACGCTCTGCATAATGACCTAAAGGTA...TAGGTACTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTTCTTGATCATCCAAAAAAGAAGATTCGGGACACACAGAAATATAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109009 TTTCTTGATCATCCAAAAAAGAAGATTCGGGACACACAGAAATATAAACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTTCAAGAGTCAAGTAAAG         AGTGGAAGGCCGTCTCTGAGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109059 TTTCAAGAGTCAAGTAAAGGTA...CAGAGTGGAAGGCCGTCTCTGAGAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TACTTTCAGAGAAGATCCTTGGGCTCCAGGTCCAGCAGGCGGAGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109986 TACTTTCAGAGAAGATCCTTGGGCTCCAGGTCCAGCAGGCGGAGCACTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCA         ATTCAGGATGCCCAGGCAGCAATGAGGCTGTACGTCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110036 TCAGTA...TAGATTCAGGATGCCCAGGCAGCAATGAGGCTGTACGTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGTGAAGAAGGAGTGGGAGAGCATGGCCCGAGACAGGCGCCCCCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110811 GGTGAAGAAGGAGTGGGAGAGCATGGCCCGAGACAGGCGCCCCCTGCTGA

   1300     .    :    .    :    .
   1238 CTGCTCCAGACCACTGCAGTGACGACGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 110861 CTGCTCCAGACCACTGCAGTGACGACGCC