seq1 = pF1KB8295.tfa, 1419 bp
seq2 = pF1KB8295/gi568815591f_99957007.tfa (gi568815591f:99957007_100164614), 207608 bp

>pF1KB8295 1419
>gi568815591f:99957007_100164614 (Chr7)

1-399  (100001-100399)   100% ->
400-592  (100692-100884)   100% ->
593-1419  (106782-107608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGACCAAGGTACTAGGCATGGCCCCAGTTCTGGGCCCTAGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGACCAAGGTACTAGGCATGGCCCCAGTTCTGGGCCCTAGGCCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGAGCAGGTGGGGCCTCTGATGGTAAAAGTCGAGGAGAAAGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGGAGCAGGTGGGGCCTCTGATGGTAAAAGTCGAGGAGAAAGAAGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGCAAGTACCTTCCTAGCCTGGAGATGTTCCGCCAGCGCTTCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGCAAGTACCTTCCTAGCCTGGAGATGTTCCGCCAGCGCTTCAGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGGGTACCATGATACCCCTGGACCCCGAGAGGCCCTGAGCCAACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGGGTACCATGATACCCCTGGACCCCGAGAGGCCCTGAGCCAACTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGCTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCCGAGATCCACACCAAGGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTGCTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCCGAGATCCACACCAAGGAGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTGGAGCTACTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACCATCCTGCCCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTGGAGCTACTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACCATCCTGCCCCAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCCAGGCCTGGGTGCAGGAGCATTGCCCGGAGAGCGCTGAAGAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCCAGGCCTGGGTGCAGGAGCATTGCCCGGAGAGCGCTGAAGAGGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACTCTCCTCGAAGATCTGGAGCGGGAACTGGATGAGCCAGGACACCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100351 CACTCTCCTCGAAGATCTGGAGCGGGAACTGGATGAGCCAGGACACCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    400         GTCTCAACTCCTCCAAACGAACAGAAACCGGTGTGGGAGAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TA...TAGGTCTCAACTCCTCCAAACGAACAGAAACCGGTGTGGGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATATCCTCCTCAGGAACTGCAAAGGAATCCCCGAGCAGCATGCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100734 ATATCCTCCTCAGGAACTGCAAAGGAATCCCCGAGCAGCATGCAGCCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCCTTGGAGACCAGTCACAAATACGAGTCTTGGGGGCCCCTGTACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100784 GCCCTTGGAGACCAGTCACAAATACGAGTCTTGGGGGCCCCTGTACATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGAGTCTGGTGAGGAGCAGGAGTTCGCTCAAGATCCAAGAAAGGTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100834 AAGAGTCTGGTGAGGAGCAGGAGTTCGCTCAAGATCCAAGAAAGGTCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 G         ATTGCAGATTGAGTACCCAGCACGAGGAATCAGCAGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 GGTG...CAGATTGCAGATTGAGTACCCAGCACGAGGAATCAGCAGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCAGAAAGGTTCTGAAGCAGAGGGGCTCAAAGGGGATATAATTTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106822 GCAGAAAGGTTCTGAAGCAGAGGGGCTCAAAGGGGATATAATTTCTGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTATCGCCAATAAACCTGAGGCCAGCTTAGAGAGGCAGTGCGTAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106872 TTATCGCCAATAAACCTGAGGCCAGCTTAGAGAGGCAGTGCGTAAACCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAAAATGAAAAAGGAACAAAACCCCCTCTTCAAGAGGCAGGCTCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106922 GAAAATGAAAAAGGAACAAAACCCCCTCTTCAAGAGGCAGGCTCCAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGGTAGAGAATCAGTTCCTACTAAACCTACCCCAGGAGAGAGACGTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106972 AGGTAGAGAATCAGTTCCTACTAAACCTACCCCAGGAGAGAGACGTTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TATGTGCTGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTAATAGCTCAAATCTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107022 TATGTGCTGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTAATAGCTCAAATCTCACCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CACAGGAGAACACACACTGGGGAGAAACCTTACGTGTGCACCAAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107072 CACAGGAGAACACACACTGGGGAGAAACCTTACGTGTGCACCAAGTGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAAAGCTTTCAGCCACAGCTCAAACCTCACCCTCCACTACAGAACACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107122 GAAAGCTTTCAGCCACAGCTCAAACCTCACCCTCCACTACAGAACACACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGGTGGACCGGCCCTATGACTGTAAGTGTGGAAAAGCTTTTGGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107172 TGGTGGACCGGCCCTATGACTGTAAGTGTGGAAAAGCTTTTGGGCAGAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCAGACCTTCTTAAACATCAGAGAATGCACACAGAAGAGGCGCCATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107222 TCAGACCTTCTTAAACATCAGAGAATGCACACAGAAGAGGCGCCATATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GTGCAAAGATTGTGGCAAGGCTTTCAGCGGGAAAGGCAGCCTCATTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107272 GTGCAAAGATTGTGGCAAGGCTTTCAGCGGGAAAGGCAGCCTCATTCGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACTATCGGATCCACACTGGGGAGAAGCCTTATCAGTGTAACGAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107322 ACTATCGGATCCACACTGGGGAGAAGCCTTATCAGTGTAACGAATGTGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AAGAGCTTCAGTCAGCATGCGGGCCTCAGCTCCCACCAGAGACTCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107372 AAGAGCTTCAGTCAGCATGCGGGCCTCAGCTCCCACCAGAGACTCCACAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CGGAGAGAAGCCATATAAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107422 CGGAGAGAAGCCATATAAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCAACCACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GCTCCAACTTCAATAAACACCACAGAATCCACACCGGGGAAAAGCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107472 GCTCCAACTTCAATAAACACCACAGAATCCACACCGGGGAAAAGCCCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TGGTGTCATCACTGTGGAAAGACCTTCTGTAGCAAGTCCAATCTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107522 TGGTGTCATCACTGTGGAAAGACCTTCTGTAGCAAGTCCAATCTTTCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .
   1383 ACATCAGCGAGTCCACACTGGAGAGGGAGAAGCACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107572 ACATCAGCGAGTCCACACTGGAGAGGGAGAAGCACCG