seq1 = pF1KB8294.tfa, 2073 bp
seq2 = pF1KB8294/gi568815586r_53611947.tfa (gi568815586r:53611947_53825242), 213296 bp

>pF1KB8294 2073
>gi568815586r:53611947_53825242 (Chr12)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-259  (100496-100598)   100% ->
260-450  (101460-101650)   100% ->
451-609  (103060-103218)   100% ->
610-758  (103628-103776)   100% ->
759-849  (105414-105504)   100% ->
850-1005  (108828-108983)   100% ->
1006-1260  (109196-109450)   99% ->
1261-1386  (109918-110043)   100% ->
1387-1482  (110550-110645)   100% ->
1483-1591  (111002-111110)   100% ->
1592-1791  (111343-111542)   100% ->
1792-1898  (112037-112143)   100% ->
1899-2073  (113122-113296)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAATCACCACTAAGCCGGGCACCATCCCGTGGTGGAGTCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAATCACCACTAAGCCGGGCACCATCCCGTGGTGGAGTCAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCAATGTAGCCCGGACCTACATCCCCAACACCAAGGTGGAATGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCAATGTAGCCCGGACCTACATCCCCAACACCAAGGTGGAATGTCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACACCCTTCCCCCAGGCACCATGCCCAGTGCCAGTGACTGGATTGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACACCCTTCCCCCAGGCACCATGCCCAGTGCCAGTGACTGGATTGGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAAG         GTGGAGGCTGCCTGTGTTCGGGATTACCACACATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCAAGGTA...CAGGTGGAGGCTGCCTGTGTTCGGGATTACCACACATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGTGGTCTTCCGTGCCTGAAAGTACAACTGATGGTTCCCCCATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100531 TGTGTGGTCTTCCGTGCCTGAAAGTACAACTGATGGTTCCCCCATTCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGTGTCCAGTTCCAAG         CCAGCTACCTGCCCAAACCAGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100581 CCAGTGTCCAGTTCCAAGGTA...CAGCCAGCTACCTGCCCAAACCAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCAGCTCTACCAGTTCCGATATGTGAACCGCCAGGGCCAGGTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101483 GCTCAGCTCTACCAGTTCCGATATGTGAACCGCCAGGGCCAGGTGTGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGAGCCCCCCTTTCCAGTTCCGAGAGCCAAGGCCCATGGATGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101533 GCAGAGCCCCCCTTTCCAGTTCCGAGAGCCAAGGCCCATGGATGAACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGACCCTGGAGGAGGCTGATGGGGGCTCTGACATCCTGCTGGTTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101583 TGACCCTGGAGGAGGCTGATGGGGGCTCTGACATCCTGCTGGTTGTCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGGCAACTGTGTTACAG         AACCAGCTCGATGAGAGCCAGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101633 AAGGCAACTGTGTTACAGGTG...TAGAACCAGCTCGATGAGAGCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAACGGAATGACCTGATGCAGCTGAAGCTACAGCTGGAGGGACAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103083 AGAACGGAATGACCTGATGCAGCTGAAGCTACAGCTGGAGGGACAGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGAGCTGAGGAGCCGAGTGCAGGAGCTCGAGAGGGCTCTGGCAACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103133 CAGAGCTGAGGAGCCGAGTGCAGGAGCTCGAGAGGGCTCTGGCAACTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGGCAGGAGCACACGGAGCTGATGGAACAGTACAAG         GGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103183 AGGCAGGAGCACACGGAGCTGATGGAACAGTACAAGGTG...CAGGGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTCCCGGTCCCATGGGGAGATCACAGAAGAGAGGGACATCCTGAGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103633 TTCCCGGTCCCATGGGGAGATCACAGAAGAGAGGGACATCCTGAGCCGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AACAGGGAGACCATGTGGCACGCATCCTGGAGCTAGAGGATGACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103683 AACAGGGAGACCATGTGGCACGCATCCTGGAGCTAGAGGATGACATCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACCATCAGTGAGAAAGTGCTGACGAAGGAAGTGGAGCTGGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103733 ACCATCAGTGAGAAAGTGCTGACGAAGGAAGTGGAGCTGGACAGGTG...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    759    GCTTAGAGACACAGTGAAGGCCCTGACTCGGGAACAAGAGAAGCTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105411 CAGGCTTAGAGACACAGTGAAGGCCCTGACTCGGGAACAAGAGAAGCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTGGGCAACTGAAAGAAGTACAAGCAGACAAGGAGCAAAGTGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105461 TTGGGCAACTGAAAGAAGTACAAGCAGACAAGGAGCAAAGTGAGGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850    GCTGAGCTCCAAGTGGCACAACAGGAGAACCATCACTTAAATTTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108825 CAGGCTGAGCTCCAAGTGGCACAACAGGAGAACCATCACTTAAATTTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCTGAAGGAGGCGAAGAGCTGGCAAGAGGAGCAGAGTGCTCAGGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108875 CCTGAAGGAGGCGAAGAGCTGGCAAGAGGAGCAGAGTGCTCAGGCTCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GACTGAAAGACAAGGTGGCCCAGATGAAGGACACCCTAGGCCAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108925 GACTGAAAGACAAGGTGGCCCAGATGAAGGACACCCTAGGCCAGGCCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGCGGGTG         GCCGAGCTGGAGCCCTTGAAGGAGCAGCTTCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108975 CAGCGGGTGGTG...GAGGCCGAGCTGGAGCCCTTGAAGGAGCAGCTTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGGGGCCCAGGAGCTTGCAGCCTCAAGCCAGCAGAAAGCCACCCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109228 AGGGGCCCAGGAGCTTGCAGCCTCAAGCCAGCAGAAAGCCACCCTTCTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGGAGGAGTTGGCCAGCGCAGCAGCAGCCAGGGACCGCACCATAGCCGAA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 109278 GGGAGGAGTTGGCCAGTGCAGCAGCAGCCAGGGACCGCACCATAGCCGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTACACCGCAGCCGCCTGGAAGTGGCTGAAGTTAACGGCAGGCTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109328 CTACACCGCAGCCGCCTGGAAGTGGCTGAAGTTAACGGCAGGCTGGCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCTCGGTTTGCACTTGAAGGAAGAAAAATGCCAATGGAGCAAGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109378 GCTCGGTTTGCACTTGAAGGAAGAAAAATGCCAATGGAGCAAGGAGCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CAGGGCTGCTGCAGAGTGTGGAG         GCAGAGAAGGACAAGATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109428 CAGGGCTGCTGCAGAGTGTGGAGGTA...CAGGCAGAGAAGGACAAGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGAAGCTGAGTGCAGAGATACTTCGATTGGAGAAGGCAGTTCAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109936 CTGAAGCTGAGTGCAGAGATACTTCGATTGGAGAAGGCAGTTCAGGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAGGACCCAAAACCAAGTGTTCAAGACTGAGCTGGCCCGGGAGAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109986 GAGGACCCAAAACCAAGTGTTCAAGACTGAGCTGGCCCGGGAGAAGGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CTAGCCTG         GTACAGTTGTCAGAAAGTAAGCGGGAGCTGACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110036 CTAGCCTGGTG...CAGGTACAGTTGTCAGAAAGTAAGCGGGAGCTGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGCTGCGGTCAGCCCTGCGTGTGCTCCAGAAGGAAAAGGAGCAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110583 GAGCTGCGGTCAGCCCTGCGTGTGCTCCAGAAGGAAAAGGAGCAGTTACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGAGGAGAAACAG         GAATTGCTAGAGTACATGAGAAAGCTAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110633 GGAGGAGAAACAGGTG...CAGGAATTGCTAGAGTACATGAGAAAGCTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGCCCGCCTGGAGAAGGTGGCAGATGAGAAGTGGAATGAGGATGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111030 AGGCCCGCCTGGAGAAGGTGGCAGATGAGAAGTGGAATGAGGATGCCACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACAGAGGATGAGGAGGCCGCTGTGGGGCTGA         GCTGCCCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111080 ACAGAGGATGAGGAGGCCGCTGTGGGGCTGAGTC...CAGGCTGCCCGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGCTCTGACAGACTCAGAGGACGAGTCCCCAGAAGACATGAGGCTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111353 AGCTCTGACAGACTCAGAGGACGAGTCCCCAGAAGACATGAGGCTCCCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCTATGGCCTTTGTGAGCGTGGAGACCCAGGCTCCTCTCCTGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111403 CCTATGGCCTTTGTGAGCGTGGAGACCCAGGCTCCTCTCCTGCTGGGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CGAGAGGCTTCTCCCCTTGTTGTCATCAGCCAGCCGGCTCCCATTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111453 CGAGAGGCTTCTCCCCTTGTTGTCATCAGCCAGCCGGCTCCCATTTCTCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TCACCTCTCTGGGCCAGCTGAGGACAGTAGCTCTGACTCG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111503 TCACCTCTCTGGGCCAGCTGAGGACAGTAGCTCTGACTCGGTG...CAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGGCTGAAGATGAGAAGTCAGTCCTGATGGCAGCTGTGCAGAGTGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112038 AGGCTGAAGATGAGAAGTCAGTCCTGATGGCAGCTGTGCAGAGTGGGGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAGGAGGCCAACTTACTGCTTCCTGAACTGGGCAGTGCCTTCTATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112088 GAGGAGGCCAACTTACTGCTTCCTGAACTGGGCAGTGCCTTCTATGACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GGCCAG         TGGCTTTACAGTGGGTACCCTGTCAGAAACCAGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112138 GGCCAGGTG...TAGTGGCTTTACAGTGGGTACCCTGTCAGAAACCAGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CTGGGGGCCCTGCCACCCCCACATGGAAGGAGTGTCCTATCTGTAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113157 CTGGGGGCCCTGCCACCCCCACATGGAAGGAGTGTCCTATCTGTAAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CGCTTTCCTGCTGAGAGTGACAAGGATGCCCTGGAGGACCACATGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113207 CGCTTTCCTGCTGAGAGTGACAAGGATGCCCTGGAGGACCACATGGATGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 ACACTTCTTTTTCAGCACCCAGGACCCCTTCACCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113257 ACACTTCTTTTTCAGCACCCAGGACCCCTTCACCTTTGAG