seq1 = pF1KB8289.tfa, 906 bp
seq2 = pF1KB8289/gi568815596r_206981216.tfa (gi568815596r:206981216_207265568), 284353 bp

>pF1KB8289 906
>gi568815596r:206981216_207265568 (Chr2)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-733  (141165-141795)   99% ->
734-857  (176988-177111)   100% ->
858-906  (184305-184353)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGTTGGCTAGTTATAGTATATTCCAGGAGCTACAACTTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTGTTGGCTAGTTATAGTATATTCCAGGAGCTACAACTTGTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACACCGGCTACTTCTCAGCTTTACCATCCCTGGAGGAGACCTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACACCGGCTACTTCTCAGCTTTACCATCCCTGGAGGAGACCTGGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         ACATGCCTTGAATTGGAACGCTACCTACAGACGGAGCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGACATGCCTTGAATTGGAACGCTACCTACAGACGGAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGAGGATCTCAGAGACCTTTGGTGAGGACTTGGACTGTTTCCTCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141204 CGGAGGATCTCAGAGACCTTTGGTGAGGACTTGGACTGTTTCCTCCACGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCCCCTCCCCCGTGCATTGAGGAAAGCTTCCGTCGCTTAGACCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141254 TTCCCCTCCCCCGTGCATTGAGGAAAGCTTCCGTCGCTTAGACCCCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTCCCCGTGGAAGCGGCCATCTGTGAGAAGAGCTCGGCAGTGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141304 TGCTCCCCGTGGAAGCGGCCATCTGTGAGAAGAGCTCGGCAGTGGACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGCTCTCTCGGGACAAGTTGCTATCTGAGACCTGCCTCAGCCTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141354 TTGCTCTCTCGGGACAAGTTGCTATCTGAGACCTGCCTCAGCCTCCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCAGCTCTTCTCTAGACAGCTACACAGCCGTCAACCAGGCCCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141404 GGCCAGCTCTTCTCTAGACAGCTACACAGCCGTCAACCAGGCCCAGCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGCAGTGACCTCATTAACGCCCCCATCGTCCCCTGAGCTCAGCCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141454 ACGCAGTGACCTCATTAACGCCCCCATCGTCCCCTGAGCTCAGCCGCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGTCAAAACCTCACAAACTCTCTCTGCCGTGGATGGCACGGTGACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141504 CTGGTCAAAACCTCACAAACTCTCTCTGCCGTGGATGGCACGGTGACGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAAACTGGTGGCCAAGAAGGCTGCTCTCAGCTCCGTAAAGGTGGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141554 GAAACTGGTGGCCAAGAAGGCTGCTCTCAGCTCCGTAAAGGTGGGAGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCGCAACAGCTGCAGCAGCCGTGACGGCTGCGGGGGCCGTTAAGAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141604 TCGCAACAGCTGCAGCAGCCGTGACGGCTGCGGGGGCCGTTAAGAGTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGAGCGACAGTGACCAAGGAGGGCTAGGGGCTGAAGCATGTCCCGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 141654 CAGAGCGACAGTGACCAAGGAGGGCTGGGGGCTGAAGCATGTCCCGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAAGAAGAGGGTTCACCGCTGTCAGTTTAACGGGTGCCGGAAAGTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141704 CAAGAAGAGGGTTCACCGCTGTCAGTTTAACGGGTGCCGGAAAGTTTATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAAAAAGCTCCCACTTAAAGGCCCACCAGAGGACTCACACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 141754 CAAAAAGCTCCCACTTAAAGGCCCACCAGAGGACTCACACAGGTA...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    734  GTGAGAAGCCTTATAAGTGCTCATGGGAGGGATGTGAGTGGCGTTTTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176987 GGTGAGAAGCCTTATAAGTGCTCATGGGAGGGATGTGAGTGGCGTTTTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ACGAAGCGATGAGCTCACGAGGCACTACAGGAAACACACAGGTGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177037 ACGAAGCGATGAGCTCACGAGGCACTACAGGAAACACACAGGTGCAAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCTTCAAATGCAACCACTGCGACAG         GTGTTTTTCCAGGTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 177087 CCTTCAAATGCAACCACTGCGACAGGTA...TAGGTGTTTTTCCAGGTCT

    900     .    :    .    :    .    :
    874 GACCATCTTGCCCTCCACATGAAGAGACATATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 184321 GACCATCTTGCCCTCCACATGAAGAGACATATC