seq1 = pF1KB8287.tfa, 1266 bp
seq2 = pF1KB8287/gi568815579r_57446978.tfa (gi568815579r:57446978_57656360), 209383 bp

>pF1KB8287 1266
>gi568815579r:57446978_57656360 (Chr19)

(complement)

1-27  (96679-96705)   100% ->
28-154  (100004-100130)   100% ->
155-250  (103639-103734)   100% ->
251-1266  (108368-109383)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGACGAAGGACGCAGCGCAG         ATGTTGGTGACCTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  96679 ATGGCGGAGACGAAGGACGCAGCGCAGGTG...CAGATGTTGGTGACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAAGGATGTGGCTGTGACCTTTACCCGGGAGGAGTGGAGACAGCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100018 CAAGGATGTGGCTGTGACCTTTACCCGGGAGGAGTGGAGACAGCTGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCCCAGAGGACCCTGTACCGAGAGGTGATGCTGGAGACCTGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100068 TGGCCCAGAGGACCCTGTACCGAGAGGTGATGCTGGAGACCTGTGGGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGTTTCACTAG         GGCATCGGGTTCCCAAACCAGAGTTGGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100118 CTGGTTTCACTAGGTA...CAGGGCATCGGGTTCCCAAACCAGAGTTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCACCTGCTAGAGCATGGGCAGGAGCTGTGGATAGTGAAGAGAGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103667 CCACCTGCTAGAGCATGGGCAGGAGCTGTGGATAGTGAAGAGAGGCCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACATGCTACCTGTGCAG         GTGACAGAGCACAAGTTCATACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103717 CACATGCTACCTGTGCAGGTA...CAGGTGACAGAGCACAAGTTCATACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGAGAGCCAACCACTTACCCGCCAGTCTTATCTGAGCGGGCCTTTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108391 AGAGAGCCAACCACTTACCCGCCAGTCTTATCTGAGCGGGCCTTTCTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGAAGCCTGACTCTGGAATCTTCAACCTCAAGTGATTCGAGGTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108441 GGGAAGCCTGACTCTGGAATCTTCAACCTCAAGTGATTCGAGGTTGGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGCTAGGGATGAGGAAGGGCTTTTGGAAATGCAGAAAGGTAAAGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108491 GAGCTAGGGATGAGGAAGGGCTTTTGGAAATGCAGAAAGGTAAAGTGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCGGAGACAGACCTCCACAAGGAGACCCATCTTGGGAAAGTGAGCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108541 CCGGAGACAGACCTCCACAAGGAGACCCATCTTGGGAAAGTGAGCCTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGTGAAGGTTTGGGGACAGATGATGGTCTGCACTCCAGGGCATTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108591 AGGTGAAGGTTTGGGGACAGATGATGGTCTGCACTCCAGGGCATTACAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTGGTTATCAGCAGATGTTCTCCATGAATGTGACTCACAGCAACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108641 AGTGGTTATCAGCAGATGTTCTCCATGAATGTGACTCACAGCAACCAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAAGACGCCTTGATTCATGCAGGGACAAACCCCTACAAATGCAAGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108691 AAAGACGCCTTGATTCATGCAGGGACAAACCCCTACAAATGCAAGCAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGGAAAGGTTTTAACAGGAAGTGGTATCTTGTTCGACATCAGAGGGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 108741 TGGGAAAGGTTTTAACAGGAAGTGGTATCTCGTTCGACATCAGAGGGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACACTGGAATGAAACCCTATGAATGCAATGCATGTGGGAAAGCCTTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108791 ACACTGGAATGAAACCCTATGAATGCAATGCATGTGGGAAAGCCTTTAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAGAGCTCAACTCTCATTCGGCACTACCTCATCCACACCGGGGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108841 CAGAGCTCAACTCTCATTCGGCACTACCTCATCCACACCGGGGAGAAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ATACAAGTGCCTTGAGTGTGGGAAGGCCTTCAAACGCAGGTCGTACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108891 ATACAAGTGCCTTGAGTGTGGGAAGGCCTTCAAACGCAGGTCGTACCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCAGCACCATCCAATCCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 108941 TGCAGCACCATCCAATCCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAGTCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGTCGAAAGGCCTTCACCCACCGGTCTACTTTTATTCGCCATAATAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108991 TGTCGAAAGGCCTTCACCCACCGGTCTACTTTTATTCGCCATAATAGGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCACACTGGAGAAAAGCCCTTTGAGTGCAAAGAATGTGAGAAAGCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109041 CCACACTGGAGAAAAGCCCTTTGAGTGCAAAGAATGTGAGAAAGCCTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GCAATAGAGCCCACCTAATTCAACATTACATCATCCACACTGGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109091 GCAATAGAGCCCACCTAATTCAACATTACATCATCCACACTGGAGAGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CCCTATGATTGCATGGCATGTGGAAAGGCCTTCAGATGCAGCTCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109141 CCCTATGATTGCATGGCATGTGGAAAGGCCTTCAGATGCAGCTCAGAACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CATACAGCACCAGCGGATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATGAATGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109191 CATACAGCACCAGCGGATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATGAATGCACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGTGTGGGAAAGCCTTTCACCGGAGCACGTACCTCATTCAGCACTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109241 AGTGTGGGAAAGCCTTTCACCGGAGCACGTACCTCATTCAGCACTCTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ATCCACACTGGGGAGATGCCCTACAAGTGTATCGAGTGTGGGAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109291 ATCCACACTGGGGAGATGCCCTACAAGTGTATCGAGTGTGGGAAGGCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CAAACGCAGGTCACACCTTCTGCAGCACCAAAGGGTCCATACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109341 CAAACGCAGGTCACACCTTCTGCAGCACCAAAGGGTCCATACA