seq1 = pF1KB8286.tfa, 1197 bp
seq2 = pF1KB8286/gi568815591r_91773597.tfa (gi568815591r:91773597_91974766), 201170 bp

>pF1KB8286 1197
>gi568815591r:91773597_91974766 (Chr7)

(complement)

1-29  (94684-94712)   100% ->
30-1197  (100003-101170)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGCCTTTCCTTAGGACAAACAAG         CATTTCAAAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  94684 ATGCAGAGCCTTTCCTTAGGACAAACAAGGTG...CAGCATTTCAAAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TTTGAACTACCTAACCATTATGGCACCAGGAAACCTCTGGCATATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 TTTGAACTACCTAACCATTATGGCACCAGGAAACCTCTGGCATATGAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATAACTTTCTCTTTGGTTCAAGATGTTGGATGACTCGATTTTCAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100065 ATAACTTTCTCTTTGGTTCAAGATGTTGGATGACTCGATTTTCAGCAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACATCTTCAAATCAGTTTCATTTAGGCTTTTTGGTGTGAAGTGTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100115 AACATCTTCAAATCAGTTTCATTTAGGCTTTTTGGTGTGAAGTGTCATAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACAGACAGTGAGCCTTTGAAAAATGAGGACCTACTGAAAAACTTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100165 TACAGACAGTGAGCCTTTGAAAAATGAGGACCTACTGAAAAACTTACTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTATGGGAGTAGATATTGACATGGCAAGGAAACGACAGCCTGGAGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100215 CTATGGGAGTAGATATTGACATGGCAAGGAAACGACAGCCTGGAGTTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATAGGATGATTACCAATGAGCAGGACCTGAAGATGTTCCTTCTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100265 CATAGGATGATTACCAATGAGCAGGACCTGAAGATGTTCCTTCTTTCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGGAGCTAGCAAAGAAGTGATCGCTAGCATCATATCAAGATATCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100315 AGGAGCTAGCAAAGAAGTGATCGCTAGCATCATATCAAGATATCCACGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAATAACACGTACTCCCGAGAATCTTTCAAAACGGTGGGATCTGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100365 CAATAACACGTACTCCCGAGAATCTTTCAAAACGGTGGGATCTGTGGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGATTGTGACATCAGACCTTGAAATTGTAAATATTTTGGAACGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100415 AAGATTGTGACATCAGACCTTGAAATTGTAAATATTTTGGAACGTTCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAATCCTTTTTTCGGTCCAATAACAACCTAAACTTAGAGAATAATATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100465 TGAATCCTTTTTTCGGTCCAATAACAACCTAAACTTAGAGAATAATATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTTCCTCTACTCAGTTGGATTGACCCGTAAATGCCTTTGTCGATTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100515 AGTTCCTCTACTCAGTTGGATTGACCCGTAAATGCCTTTGTCGATTGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACCAATGCCCCTCGTACCTTCTCCAATAGTCTTGATCTGAATAAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100565 ACCAATGCCCCTCGTACCTTCTCCAATAGTCTTGATCTGAATAAACAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGTTGAATTTTTGCAGGCAGCCGGTTTGTCATTGGGTCACAATGATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100615 GGTTGAATTTTTGCAGGCAGCCGGTTTGTCATTGGGTCACAATGATCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAGATTTTGTCAGAAAGATAATTTTTAAAAACCCTTTTATCTTAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100665 CAGATTTTGTCAGAAAGATAATTTTTAAAAACCCTTTTATCTTAATTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCACCAAGCGGGTGAAAGCTAACATTGAATTCTTACGGTCAACTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100715 AGCACCAAGCGGGTGAAAGCTAACATTGAATTCTTACGGTCAACTTTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTTGAACAGTGAGGAACTGCTGGTTCTGATATGTGGTCCAGGAGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100765 TTTGAACAGTGAGGAACTGCTGGTTCTGATATGTGGTCCAGGAGCTGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCTAGACCTTTCCAATGACTATGCCAGAAGAAGCTACGCAAACATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100815 TCCTAGACCTTTCCAATGACTATGCCAGAAGAAGCTACGCAAACATCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGAAGCTGTTTTCTCTTGGATGTACTGAAGAAGAGGTACAGAAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 GAGAAGCTGTTTTCTCTTGGATGTACTGAAGAAGAGGTACAGAAGTTTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTAAGCTATCCAGATGTGATCTTCTTGGCAGAGAAAAAGTTTAATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100915 CTTAAGCTATCCAGATGTGATCTTCTTGGCAGAGAAAAAGTTTAATGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AAATAGACTGCCTCATGGAAGAAAACATTAGCATTTCACAAATAATCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100965 AAATAGACTGCCTCATGGAAGAAAACATTAGCATTTCACAAATAATCGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AATCCTCGGGTTCTGGATTCAAGCATAAGTACTTTAAAAAGTCGAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101015 AATCCTCGGGTTCTGGATTCAAGCATAAGTACTTTAAAAAGTCGAATCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGAATTGGTAAATGCTGGCTGTAACTTGAGTACTTTAAACATCACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101065 AGAATTGGTAAATGCTGGCTGTAACTTGAGTACTTTAAACATCACTCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TATCTTGGAGTAAAAAAAGATATGAAGCTAAATTGAAAAAGTTAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101115 TATCTTGGAGTAAAAAAAGATATGAAGCTAAATTGAAAAAGTTAAGCAGA

   1200     .
   1192 TTTGCC
        ||||||
 101165 TTTGCC