seq1 = pF1KB8283.tfa, 876 bp
seq2 = pF1KB8283/gi568815579f_36136441.tfa (gi568815579f:36136441_36337316), 200876 bp

>pF1KB8283 876
>gi568815579f:36136441_36337316 (Chr19)

1-876  (100001-100876)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCACACCTCAGCCAGCAGAAAATTTACAGTGGGGAAAACCCCTTTGC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCACACCTCAGCCAGCAGAGAATTTACAGTGGGGAAAACCCCTTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTAAGGTATGTGGAAAAGTCTTCAGCCACAAATCAAACCTCACTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTAAGGTATGTGGAAAAGTCTTCAGCCACAAATCAAACCTCACTGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAGCATTTTCACACGAGAGAGAAACCTTTTGAATGTAACGAGTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAGCATTTTCACACGAGAGAGAAACCTTTTGAATGTAACGAGTGTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGCCTTTAGCCAAAAGCAGTATGTCATTAAACATCAGAACACCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAGCCTTTAGCCAAAAGCAGTATGTCATTAAACATCAGAACACCCATAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCGAGAAGCTTTTCGAATGTAATGAATGTGGAAAATCATTTAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCGAGAAGCTTTTCGAATGTAATGAATGTGGAAAATCATTTAGCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAAAACCTCCTTACGCACCAGAAAATTCACACTGGAGAAAAACCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAAAACCTCCTTACGCACCAGAAAATTCACACTGGAGAAAAACCTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGTGTAAAGATTGCGGGAAAGCTTTCATTCAGAAGTCAAACCTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGTGTAAAGATTGCGGGAAAGCTTTCATTCAGAAGTCAAACCTCATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACACCAGAGAACTCACACAGGAGAGAAGCCCTTTGTATGTAAGGAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACACCAGAGAACTCACACAGGAGAGAAGCCCTTTGTATGTAAGGAGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAAAAACCTTCAGTGGCAAATCCAACCTTACTGAGCATGAGAAAATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAAAAACCTTCAGTGGCAAATCCAACCTTACTGAGCATGAGAAAATCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGAACAGCCTTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGAACAGCCTTTGGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGAAGTACCTCATAAAACATCAGAACATTCACACTGGAGAGAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGAAGTACCTCATAAAACATCAGAACATTCACACTGGAGAGAAACCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGAATGTAACGAATGTGGAAAAGCCTTCTCTCAGCGAACATCACTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGAATGTAACGAATGTGGAAAAGCCTTCTCTCAGCGAACATCACTTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTACATGTGAGGATTCATTCAGGTGATAAACCTTACGAATGCAATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTACATGTGAGGATTCATTCAGGTGATAAACCTTACGAATGCAATGTTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGAAAAGCCTTCTCTCAGAGCTCATCTCTCACTGTGCATGTGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGAAAAGCCTTCTCTCAGAGCTCATCTCTCACTGTGCATGTGAGAAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATACAGGGGAGAAGCCCTATGGTTGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATACAGGGGAGAAGCCCTATGGTTGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGTTCTCAACCCTTGCTCTGCATTTGAGAATACACACAGGTAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGTTCTCAACCCTTGCTCTGCATTTGAGAATACACACAGGTAAGAAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTATCAGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCCAGAAGTCACACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTATCAGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCCAGAAGTCACACCACA

    850     .    :    .    :    .
    851 TTAGACACCAGAAAATTCATACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTAGACACCAGAAAATTCATACTCAC