seq1 = pF1KB8280.tfa, 570 bp
seq2 = pF1KB8280/gi568815594f_2397007.tfa (gi568815594f:2397007_2613816), 216810 bp

>pF1KB8280 570
>gi568815594f:2397007_2613816 (Chr4)

10-124  (100001-100115)   100% ->
125-204  (103653-103732)   100% ->
205-374  (115432-115591)   94% ->
375-423  (116077-116125)   100% ->
424-570  (116664-116810)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 AGAAAGCGTCGTGGTGGAGCAATAAATTCTAGACAAGCTCAGAAGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGAAAGCGTCGTGGTGGAGCAATAAATTCTAGACAAGCTCAGAAGCGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 TCGGGAAGCAACCTCCACCCCCGAGATCTCCTTGGAAGCAGAACCCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGGAAGCAACCTCCACCCCCGAGATCTCCTTGGAAGCAGAACCCATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 AACTCGTGGAAACTG         CTGGAGATGAAATTGTGGACCTCACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACTCGTGGAAACTGGTA...AAGCTGGAGATGAAATTGTGGACCTCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTGAATCTTTAGAGCCTGTGGTGGTTGATCTGACTCACAATGACTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103679 TGTGAATCTTTAGAGCCTGTGGTGGTTGATCTGACTCACAATGACTCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTG         ATTGTTGACGAAAGAAGAAGACCAAGGAGGAATGCTA
        ||||>>>...>>>----------|||||||||||||||||||||||||||
 103729 TGTGGTA...TAG          AAAGAAGAAGACCAAGGAGGAATGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGAGGCTGCCCCAGGACCATGCTGACAGCTGTGTGGTGAGCAGTGACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115459 GGAGGCTGCCCCAGGACCATGCTGACAGCTGTGTGGTGAGCAGTGACGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGAGTTGTCCAGGGACAGAGACGTATATGTGACTACCCATACTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115509 GAGGAGTTGTCCAGGGACAGAGACGTATATGTGACTACCCATACTCCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAACGCCAGGGATGAGGGCGCTACAGGCCTCAG         GCCCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115559 AAACGCCAGGGATGAGGGCGCTACAGGCCTCAGGTA...TAGGCCCTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTACTGTCAGTTGTCCCATCTGCATGGACGGATACTCAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116085 GTACTGTCAGTTGTCCCATCTGCATGGACGGATACTCAGAGGTA...TAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCGTGCAGAATGGACGTCTCATCGTTTCCACAGAATGCGGCCATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116664 ATCGTGCAGAATGGACGTCTCATCGTTTCCACAGAATGCGGCCATGTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGTAGCCAGTGCCTCCGTGATTCCCTGAAGAATGCTAATACTTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116714 CTGTAGCCAGTGCCTCCGTGATTCCCTGAAGAATGCTAATACTTGCCCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    524 CTTGTAGGAAAAAGATCAACCACAAACGGTACCACCCCATTTATATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116764 CTTGTAGGAAAAAGATCAACCACAAACGGTACCACCCCATTTATATA