seq1 = pF1KB8279.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB8279/gi568815592r_28226169.tfa (gi568815592r:28226169_28429683), 203515 bp

>pF1KB8279 1218
>gi568815592r:28226169_28429683 (Chr6)

(complement)

1-381  (100001-100381)   100% ->
382-532  (102151-102301)   100% ->
533-1218  (102830-103515)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCAACAGAGGAACAGTACGATCTTAAGATTGTGAAAGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCAACAGAGGAACAGTACGATCTTAAGATTGTGAAAGTGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACCCTATCTGGGACCAAGAAACCCACCTTCGAGGGAACAACTTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACCCTATCTGGGACCAAGAAACCCACCTTCGAGGGAACAACTTTTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCAAGAAGCCTCCCGACAACTTTTTAGGCAGTTTTGTTACCAAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCAAGAAGCCTCCCGACAACTTTTTAGGCAGTTTTGTTACCAAGAGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGGTCCCCGAGAAGCTCTGAGCCGGCTCCGAGAACTCTGTCATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGGTCCCCGAGAAGCTCTGAGCCGGCTCCGAGAACTCTGTCATCAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTAAGGCCAGAAATCCACACCAAAGAGCAAATCTTGGAGCTGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTAAGGCCAGAAATCCACACCAAAGAGCAAATCTTGGAGCTGCTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAGCAATTCCTGACTATCCTGCCTGAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGAGCAATTCCTGACTATCCTGCCTGAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCACCATCCGGAGAGTGGGGAGGAGGCTGTGGCTGTAGTTGAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCACCATCCGGAGAGTGGGGAGGAGGCTGTGGCTGTAGTTGAAGATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAACAAGAGCTTAGTGAGCCAGGGAACCAG         GCTCCAGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100351 GGAACAAGAGCTTAGTGAGCCAGGGAACCAGGTG...CAGGCTCCAGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAACATGGACATTCTGAAGTGCTCTTGGAGGATGTGGAACATCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102161 ATGAACATGGACATTCTGAAGTGCTCTTGGAGGATGTGGAACATCTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTCAAGCAGGAACCAACAGACATACAGCTTCAGCCTATGGTGACACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102211 GTCAAGCAGGAACCAACAGACATACAGCTTCAGCCTATGGTGACACAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAGATATGAATCTTTTTGCCTCCACCAATTTCAAGAACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102261 CAGATATGAATCTTTTTGCCTCCACCAATTTCAAGAACAAGGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGGTGAAAGTATACCTGAGAACCAGGAGTTGGCATCAAAGCAAGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102830 ATGGTGAAAGTATACCTGAGAACCAGGAGTTGGCATCAAAGCAAGAAATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTAAAAGAAATGGAACATTTGGGGGATAGCAGACTCCAAAGAGATGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 102880 TTAAAAGAAATGGAACATTTGGGGGATAGCAAACTCCAAAGAGATGTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTGGATTCTAAGTACAGAGAAACTTGTAAACGAGACAGCAAGGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102930 TTTGGATTCTAAGTACAGAGAAACTTGTAAACGAGACAGCAAGGCAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCAGCAGGCACATTCCACTGGAGAGAGACGCCACAGGTGCAATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102980 AGCAGCAGGCACATTCCACTGGAGAGAGACGCCACAGGTGCAATGAATGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GGGAAAAGCTTCACTAAGAGTTCAGTACTCATTGAGCACCAGAGAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103030 GGGAAAAGCTTCACTAAGAGTTCAGTACTCATTGAGCACCAGAGAATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CACTGGGGAGAAGCCATATGAATGTGAAGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103080 CACTGGGGAGAAGCCATATGAATGTGAAGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GGAGGTCAAGCCTGAATGAACATCGGCGGAGCCACACTGGAGAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103130 GGAGGTCAAGCCTGAATGAACATCGGCGGAGCCACACTGGAGAGAAACCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TATCAATGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTGCCAGCAATGGCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103180 TATCAATGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTGCCAGCAATGGCCTCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TCGACACAGAAGAATCCACACAGGGGAAAAACCATATGAATGCAAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103230 TCGACACAGAAGAATCCACACAGGGGAAAAACCATATGAATGCAAAGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTGGGAAGGCTTTCCTCCTCAGCTCATGCCTTGTTCAGCATCAGAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 GTGGGAAGGCTTTCCTCCTCAGCTCATGCCTTGTTCAGCATCAGAGGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CACACTGGAGAGAAGCGCTATCAGTGTCGTGAGTGTGGCAAAGCCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 CACACTGGAGAGAAGCGCTATCAGTGTCGTGAGTGTGGCAAAGCCTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TCAGAATGCAGGGCTTTTCCAGCATCTCCGAGTCCACACTGGTGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103380 TCAGAATGCAGGGCTTTTCCAGCATCTCCGAGTCCACACTGGTGAGAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCTATCAGTGCAGTCAGTGCAGTAAACTCTTTAGTAAGCGGACACTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103430 CCTATCAGTGCAGTCAGTGCAGTAAACTCTTTAGTAAGCGGACACTTCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1183 AAGAAACATCAGAAAATCCACACTGGAGAGAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103480 AAGAAACATCAGAAAATCCACACTGGAGAGAGACCA