seq1 = pF1KB8277.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KB8277/gi568815583r_60247633.tfa (gi568815583r:60247633_60497913), 250281 bp

>pF1KB8277 1071
>gi568815583r:60247633_60497913 (Chr15)

(complement)

1-43  (100001-100043)   97% ->
44-102  (111828-111886)   100% ->
103-202  (115473-115572)   100% ->
203-297  (133391-133485)   100% ->
298-411  (136860-136973)   100% ->
412-502  (140678-140768)   100% ->
503-582  (141916-141995)   100% ->
583-642  (143701-143760)   100% ->
643-736  (145438-145531)   100% ->
737-832  (146095-146190)   100% ->
833-891  (146663-146721)   100% ->
892-1014  (148717-148839)   100% ->
1015-1071  (150225-150281)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCCAGCTAGCGGGGTGCGGAGACGCTGGGAAGAAGG       
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGGGCCGCCAGCTAGCGGGGTGTGGAGACGCTGGGAAGAAGGGTA...C

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   CTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111826 AGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAGGGTGAT         CACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 111876 TGGAGGGTGATGTA...CAGCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCAAAGCCTATACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115503 GTCAAAGCCTATACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AACAGCCATCAAGACCAAAG         GTGTGGATGAGGTCACCATTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115553 AACAGCCATCAAGACCAAAGGTA...TAGGTGTGGATGAGGTCACCATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAACATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133412 TCAACATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAG         GAACTTGCATCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 133462 GCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGTA...AAGGAACTTGCATCAGCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136877 GAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136927 AGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412       GGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCATCTGCTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136977 ...CAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCATCTGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 140722 CAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    503       TGTACAAGACTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140772 ...AAGTGTACAAGACTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAG         GGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 141960 GGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGTT...TAGGGTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143706 AAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTCGG         GATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAAAGGAACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143756 CTCGGGTA...TAGGATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAAAGGAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145474 GATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CCAGAAAG         TATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 145524 CCAGAAAGGTG...CAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146128 ACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TTCCTGAACCTGG         TTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 146178 TTCCTGAACCTGGGTA...CAGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TTTTGCTGATCGGCTGTATGACTCCATGAAG         GGCAAGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 146691 TTTTGCTGATCGGCTGTATGACTCCATGAAGGTA...CAGGGCAAGGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 CGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148727 CGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 ATGTTGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148777 ATGTTGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CTATTATATCCAG         CAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 148827 CTATTATATCCAGGTA...TAGCAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAAG

   1150     .    :    .    :    .
   1043 CGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 150253 CGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC