seq1 = pF1KB8276.tfa, 417 bp
seq2 = pF1KB8276/gi568815579r_18207467.tfa (gi568815579r:18207467_18416066), 208600 bp

>pF1KB8276 417
>gi568815579r:18207467_18416066 (Chr19)

(complement)

1-45  (100000-100043)   97% ->
46-144  (103365-103463)   100% ->
145-328  (106206-106389)   100% ->
329-417  (108512-108600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCCCTTGTCACTGCTGAAGACGGCTCAGAATCACCCCATG     
        |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100000 A GCTTCCCTTGTCACTGCTGAAGACGGCTCAGAATCACCCCATGGTG..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     TTGGTGGAGCTGAAAAATGGGGAGACGTACAATGGACACCTGGTGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 .TAGTTGGTGGAGCTGAAAAATGGGGAGACGTACAATGGACACCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTGCGACAACTGGATGAACATTAACCTGCGAGAAGTCATCTGCACGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103411 GCTGCGACAACTGGATGAACATTAACCTGCGAGAAGTCATCTGCACGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGG         GACGGGGACAAGTTCTGGCGGATGCCCGAGTGCTACAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103461 AGGGTG...CAGGACGGGGACAAGTTCTGGCGGATGCCCGAGTGCTACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGCGGCAGCACCATCAAGTACCTGCGCATCCCCGACGAGATCATCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106244 CCGCGGCAGCACCATCAAGTACCTGCGCATCCCCGACGAGATCATCGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTCAAGGAGGAGGTGGTGGCCAAGGGCCGCGGCCGCGGAGGCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106294 TGGTCAAGGAGGAGGTGGTGGCCAAGGGCCGCGGCCGCGGAGGCCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCAGAAGCAGCAGAAAGGCCGCGGCATGGGCGGCGCTGGCCGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106344 CAGCAGAAGCAGCAGAAAGGCCGCGGCATGGGCGGCGCTGGCCGAGGTG.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329      GTGTGTTTGGTGGCCGGGGCCGAGGTGGGATCCCGGGCACAGGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106394 ..TAGGTGTGTTTGGTGGCCGGGGCCGAGGTGGGATCCCGGGCACAGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGGCCAGCCAGAGAAGAAGCCTGGCAGACAGGCGGGCAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108557 GAGGCCAGCCAGAGAAGAAGCCTGGCAGACAGGCGGGCAAACAG