seq1 = pF1KB8273.tfa, 831 bp
seq2 = pF1KB8273/gi568815589r_124253601.tfa (gi568815589r:124253601_124515425), 261825 bp

>pF1KB8273 831
>gi568815589r:124253601_124515425 (Chr9)

(complement)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-156  (100491-100584)   100% ->
157-254  (101421-101518)   100% ->
255-395  (102934-103074)   100% ->
396-511  (109994-110109)   100% ->
512-570  (130770-130828)   100% ->
571-722  (158511-158662)   100% ->
723-831  (161717-161825)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGTGTCGGTGTATGCTCCACCAGTTGGAGGCTTCTCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTGTGTCGGTGTATGCTCCACCAGTTGGAGGCTTCTCTTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAACTGCCGCAG         GAATGCCGTCTTGGAAGCCGATTTTGCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAACTGCCGCAGGTG...TAGGAATGCCGTCTTGGAAGCCGATTTTGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGGGGATACAAGCTTCCAAAGGTCCGGAAAACTGGCACGACCATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100520 AGAGGGGATACAAGCTTCCAAAGGTCCGGAAAACTGGCACGACCATCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGGTGGTCTATAAG         GATGGCATAGTTCTTGGAGCAGATAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100570 GGGGTGGTCTATAAGGTA...TAGGATGGCATAGTTCTTGGAGCAGATAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGAGCAACTGAAGGGATGGTTGTTGCTGACAAGAACTGTTCAAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101447 AAGAGCAACTGAAGGGATGGTTGTTGCTGACAAGAACTGTTCAAAAATAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTCATATCTCCTAATATTTA         TTGTTGTGGTGCTGGGACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101497 ACTTCATATCTCCTAATATTTAGTA...CAGTTGTTGTGGTGCTGGGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCTGCAGACACAGACATGACAACCCAGCTCATTTCTTCCAACCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102953 GCTGCAGACACAGACATGACAACCCAGCTCATTTCTTCCAACCTGGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCACTCCCTCTCCACTGGCCGTCTTCCCAGAGTTGTGACAGCCAATCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103003 CCACTCCCTCTCCACTGGCCGTCTTCCCAGAGTTGTGACAGCCAATCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCTGAAGCAGATGCTTTTCAG         GTATCAAGGTTACATTGGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103053 TGCTGAAGCAGATGCTTTTCAGGTA...CAGGTATCAAGGTTACATTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAGCCCTAGTTTTAGGGGGAGTAGATGTTACTGGACCTCACCTCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110013 GCAGCCCTAGTTTTAGGGGGAGTAGATGTTACTGGACCTCACCTCTACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATCTATCCTCATGGATCAACTGATAAGTTGCCTTATGTCACCATGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110063 CATCTATCCTCATGGATCAACTGATAAGTTGCCTTATGTCACCATGGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512       GTTCTGGCTCCTTGGCAGCAATGGCTGTATTTGAAGATAAGTTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110113 ...CAGGTTCTGGCTCCTTGGCAGCAATGGCTGTATTTGAAGATAAGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGCCAGACATGGAG         GAGGAGGAAGCCAAGAATCTGGTGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130814 AGGCCAGACATGGAGGTA...CAGGAGGAGGAAGCCAAGAATCTGGTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CGAAGCCATCGCAGCTGGCATCTTCAACGACCTGGGCTCCGGAAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158537 CGAAGCCATCGCAGCTGGCATCTTCAACGACCTGGGCTCCGGAAGCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTGACCTCTGCGTCATCAGCAAGAACAAGCTGGATTTTCTCCGCCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158587 TTGACCTCTGCGTCATCAGCAAGAACAAGCTGGATTTTCTCCGCCCATAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACAGTGCCCAACAAGAAGGGGACCAG         GCTTGGCCGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 158637 ACAGTGCCCAACAAGAAGGGGACCAGGTG...TAGGCTTGGCCGGTACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GTGTGAGAAAGGGACTACTGCAGTCCTCACTGAGAAAATCACTCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161732 GTGTGAGAAAGGGACTACTGCAGTCCTCACTGAGAAAATCACTCCTCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGATTGAGGTGCTGGAAGAAACAGTCCAAACAATGGACACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161782 AGATTGAGGTGCTGGAAGAAACAGTCCAAACAATGGACACTTCC