seq1 = pF1KB8270.tfa, 807 bp
seq2 = pF1KB8270/gi568815579f_472635.tfa (gi568815579f:472635_682574), 209940 bp

>pF1KB8270 807
>gi568815579f:472635_682574 (Chr19)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-224  (106866-107022)   99% ->
225-307  (107745-107827)   98% ->
308-444  (108012-108148)   100% ->
445-721  (108681-108957)   100% ->
722-746  (109672-109696)   100% ->
747-807  (109880-109940)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGCGCTGTTCGTGCTGCTGGGATTCGCGCTGCTGGGCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTGCGCTGTTCGTGCTGCTGGGATTCGCGCTGCTGGGCACCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGAGCCTCCGGGGCTG         CCGGCACAGTCTTCACTACCGTAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGAGCCTCCGGGGCTGGTG...CAGCCGGCACAGTCTTCACTACCGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGACCTTGGCTCCAAGATACTCCTCACCTGCTCCTTGAATGACAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106890 AAGACCTTGGCTCCAAGATACTCCTCACCTGCTCCTTGAATGACAGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAGAGGTCACAGGGCACCGCTGGCTGAAGGGGGGCGTGGTGCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106940 ACAGAGGTCACAGGGCACCGCTGGCTGAAGGGGGGCGTGGTGCTGAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATGCGCTGCCCGGCCAGAAAACGGAGTTCAA         GGTGGACT
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106990 GGACGCGCTGCCCGGCCAGAAAACGGAGTTCAAGTG...CAGGGTGGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGACGACCAGTGGGGAGAGTACTCCTGCGTCTTCCTCCCCGAGCCCATG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107753 CCGACGACCAGTGGGGAGAGTACTCCTGCGTCTTCCTCCCCGAGCCCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCACGGCCAACATCCAGCTCCACG         GGCCTCCCAGAGTGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107803 GGCACGGCCAACATCCAGCTCCACGGTG...CAGGGCCTCCCAGAGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCTGTGAAGTCGTCAGAACACATCAACGAGGGGGAGACGGCCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108028 GGCTGTGAAGTCGTCAGAACACATCAACGAGGGGGAGACGGCCATGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108078 TCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCACTGACTCTGAGGACAAG         GCCCTCATGAACGGCTCCGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 108128 ATCACTGACTCTGAGGACAAGGTG...TAGGCCCTCATGAACGGCTCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGCAGGTTCTTCGTGAGTTCCTCGCAGGGCCGGTCAGAGCTACACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108701 GAGCAGGTTCTTCGTGAGTTCCTCGCAGGGCCGGTCAGAGCTACACATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGAACCTGAACATGGAGGCCGACCCCGGCCAGTACCGGTGCAACGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108751 AGAACCTGAACATGGAGGCCGACCCCGGCCAGTACCGGTGCAACGGCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCTCCAAGGGCTCCGACCAGGCCATCATCACGCTCCGCGTGCGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108801 AGCTCCAAGGGCTCCGACCAGGCCATCATCACGCTCCGCGTGCGCAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTGGCCGCCCTCTGGCCCTTCCTGGGCATCGTGGCTGAGGTGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108851 CCTGGCCGCCCTCTGGCCCTTCCTGGGCATCGTGGCTGAGGTGCTGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGTCACCATCATCTTCATCTACGAGAAGCGCCGGAAGCCCGAGGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108901 TGGTCACCATCATCTTCATCTACGAGAAGCGCCGGAAGCCCGAGGACGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGATG         ATGACGACGCCGGCTCTGCACCCCT         
        |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108951 CTGGATGGTG...CAGATGACGACGCCGGCTCTGCACCCCTGTA...CAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAAGAGCAGCGGGCAGCACCAGAATGACAAAGGCAAGAACGTCCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109880 GAAGAGCAGCGGGCAGCACCAGAATGACAAAGGCAAGAACGTCCGCCAGA

    850     .    :
    797 GGAACTCTTCC
        |||||||||||
 109930 GGAACTCTTCC