seq1 = pF1KB8269.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KB8269/gi568815597r_35503270.tfa (gi568815597r:35503270_35741432), 238163 bp

>pF1KB8269 603
>gi568815597r:35503270_35741432 (Chr1)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-214  (105001-105123)   100% ->
215-285  (110089-110159)   100% ->
286-448  (132025-132187)   100% ->
449-498  (136151-136200)   100% ->
499-603  (138059-138163)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTACCTCATCGGTATCCAAGGCCCCGACTATGTTCTTGTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTACCTCATCGGTATCCAAGGCCCCGACTATGTTCTTGTCGCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCGGGTGGCCGCCAGCAATATTGTCCAGATGAAGGACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 CGACCGGGTGGCCGCCAGCAATATTGTCCAGATGAAGGACGGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCATGACAAGATGTTTAAGATGAGTGAAAAGATATTACTCCTGTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105001 ATCATGACAAGATGTTTAAGATGAGTGAAAAGATATTACTCCTGTGTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGAGGCTGGAGACACTGTACAGTTTGCAGAATATATTCAGAAAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105051 GGAGAGGCTGGAGACACTGTACAGTTTGCAGAATATATTCAGAAAAACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAACTTTATAAGATGCGAAATG         GATATGAATTGTCTCCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105101 GCAACTTTATAAGATGCGAAATGGTG...CAGGATATGAATTGTCTCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGCAGCAGCTAACTTCACACGCCGAAACCTGGCTGACTGTCTTCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110107 CGGCAGCAGCTAACTTCACACGCCGAAACCTGGCTGACTGTCTTCGGAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGG         ACCCCATATCATGTGAACCTCCTCCTGGCTGGCTATGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110157 CGGGTA...CAGACCCCATATCATGTGAACCTCCTCCTGGCTGGCTATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGCATGAAGGGCCAGCGCTGTATTACATGGACTACCTGGCAGCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132063 TGAGCATGAAGGGCCAGCGCTGTATTACATGGACTACCTGGCAGCCTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAAGGCCCCTTTTGCAGCCCACGGCTATGGTGCCTTCCTGACTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132113 CCAAGGCCCCTTTTGCAGCCCACGGCTATGGTGCCTTCCTGACTCTCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCCTCGACCGATACTACACACCGA         CTATCTCACGTGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 132163 ATCCTCGACCGATACTACACACCGAGTA...CAGCTATCTCACGTGAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCAGTGGAACTCCTTAGGAAATGTCTGGAGGAG         CTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 136167 GGCAGTGGAACTCCTTAGGAAATGTCTGGAGGAGGTG...CAGCTCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AACGCTTCATCCTGAATCTGCCAACCTTCAGTGTTCGAATCATTGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138066 AACGCTTCATCCTGAATCTGCCAACCTTCAGTGTTCGAATCATTGACAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    556 AATGGCATCCATGACCTGGATAACATTTCCTTCCCCAAACAGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138116 AATGGCATCCATGACCTGGATAACATTTCCTTCCCCAAACAGGGCTCC