seq1 = pF1KB8267.tfa, 693 bp
seq2 = pF1KB8267/gi568815578r_2362635.tfa (gi568815578r:2362635_2567759), 205125 bp

>pF1KB8267 693
>gi568815578r:2362635_2567759 (Chr20)

(complement)

1-155  (100000-100153)   99% ->
156-267  (101941-102052)   100% ->
268-420  (103861-104013)   100% ->
421-559  (104533-104671)   100% ->
560-686  (104999-105125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGAT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCGGATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCGGATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 TTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAA         GCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 ATCAAGTG...TAGGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGGGAGAATCTGGTCTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101977 GCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGGGAGAATCTGGTCTCAATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGAT         ACTGGTATTGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102027 CAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGATGTA...CAGACTGGTATTGCTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCCACTTGCTGGAGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103876 GTTCCACTTGCTGGAGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTCCTGCAGGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103926 CAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTCCTGCAGGACTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103976 CTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAGGTG...TAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATGACCCCACAAGGAAGAGGTACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104536 ATGACCCCACAAGGAAGAGGTACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104586 AGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGGGGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAG         GCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104636 CTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAGGTG...CAGGCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTCCTATGGGTCCCCCAATGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105004 ATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTCCTATGGGTCCCCCAATGGGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105054 CCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGC

    700     .    :    .    :
    665 CTCCTCCCCCTGGGATGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||
 105104 CTCCTCCCCCTGGGATGCGAGG