seq1 = pF1KB8265.tfa, 1353 bp
seq2 = pF1KB8265/gi568815586r_49027961.tfa (gi568815586r:49027961_49185012), 157052 bp

>pF1KB8265 1353
>gi568815586r:49027961_49185012 (Chr12)

(complement)

1-226  (55289-55513)   99% ->
227-375  (55623-55771)   100% ->
376-1353  (56075-57052)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGG
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55289 A GCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55338 CAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55388 GCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55438 ACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTAGACTTGGAACCCACAGTCATTG         ATGAAGTTCGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  55488 TGTAGACTTGGAACCCACAGTCATTGGTG...CAGATGAAGTTCGCACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55638 GCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGCTGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  55688 GATGCTGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCAAGCTG         GCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  55738 CATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCAAGCTGGTA...CAGGCTGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56082 AGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTGGTTCTGGGTTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56132 ACTGGTTCTGGGTTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGCAAGAAATCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCCGGCACCCCAGGTTT
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
  56182 TGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCCAGCACCCCAGGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56232 CCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGAGCACTCTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56282 CTGGAGCACTCTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCAACCTACACTAACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56332 CATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCAACCTACACTAACCTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56382 ACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GATGGAGCCCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56432 GATGGAGCCCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACATATGCCCCTGTCATCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56482 CTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACATATGCCCCTGTCATCTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56532 CTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGCTTTGAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56582 TGCTTTGAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGGTGACGTGGTTCCCAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56632 ATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGGTGACGTGGTTCCCAAAGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56682 TCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GATTGGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56732 GATTGGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAGGTACAGAGAGCTGTGTGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56782 TGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAGGTACAGAGAGCTGTGTGCATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56832 TGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TTTGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56882 TTTGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAGAGGCCCGTGAAGATATGGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56932 GGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAGAGGCCCGTGAAGATATGGCTGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56982 TTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT

   1350     .    :    .    :
   1333 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC
        |||||||||||||||||||||
  57032 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC