seq1 = pF1KB8263.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KB8263/gi568815579r_39734667.tfa (gi568815579r:39734667_39940790), 206124 bp

>pF1KB8263 963
>gi568815579r:39734667_39940790 (Chr19)

(complement)

8-181  (100001-100174)   100% ->
182-283  (100276-100377)   100% ->
284-378  (100464-100558)   100% ->
379-549  (101586-101756)   100% ->
550-682  (102948-103080)   100% ->
683-795  (104123-104235)   100% ->
796-941  (105978-106123)   100% ->
942-963  (106229-106250)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 CAGGATTCAGTCCCCGTGGGGGTGGCTTTGGCGGCCGAGGGGGCTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGATTCAGTCCCCGTGGGGGTGGCTTTGGCGGCCGAGGGGGCTTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 GACCGTGGTGGTCGTGGAGGCCGAGGGGGCTTTGGCGGGGGCCGAGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCGTGGTGGTCGTGGAGGCCGAGGGGGCTTTGGCGGGGGCCGAGGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 AGGCGGAGGCTTTAGAGGTCGTGGACGAGGAGGAGGTGGAGGCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCGGAGGCTTTAGAGGTCGTGGACGAGGAGGAGGTGGAGGCGGCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 GCGGTGGAGGAGGAGGAAGAGGTG         GTGGAGGCTTCCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 GCGGTGGAGGAGGAGGAAGAGGTGGTA...TAGGTGGAGGCTTCCATTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 GGTGGCAACCGGGGTCGTGGTCGGGGAGGAAAAAGAGGAAACCAGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100293 GGTGGCAACCGGGGTCGTGGTCGGGGAGGAAAAAGAGGAAACCAGTCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 GAAGAATGTGATGGTGGAGCCGCATCGGCATGAGG         GTGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100343 GAAGAATGTGATGGTGGAGCCGCATCGGCATGAGGGTG...CAGGTGTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290 TCATTTGTCGAGGAAAGGAAGATGCACTGGTCACCAAGAACCTGGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100470 TCATTTGTCGAGGAAAGGAAGATGCACTGGTCACCAAGAACCTGGTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340 GGGGAATCAGTTTATGGAGAGAAGAGAGTCTCGATTTCG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100520 GGGGAATCAGTTTATGGAGAGAAGAGAGTCTCGATTTCGGTG...TAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381 AGGAGATGACAAAATTGAGTACCGAGCCTGGAACCCCTTCCGCTCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101588 AGGAGATGACAAAATTGAGTACCGAGCCTGGAACCCCTTCCGCTCCAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431 TAGCAGCAGCAATCCTGGGTGGTGTGGACCAGATCCACATCAAACCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101638 TAGCAGCAGCAATCCTGGGTGGTGTGGACCAGATCCACATCAAACCGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481 GCTAAGGTTCTCTACCTCGGGGCTGCCTCGGGCACCACGGTCTCCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 GCTAAGGTTCTCTACCTCGGGGCTGCCTCGGGCACCACGGTCTCCCATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531 CTCTGACATCGTTGGTCCG         GATGGTCTAGTCTATGCAGTCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101738 CTCTGACATCGTTGGTCCGGTG...TAGGATGGTCTAGTCTATGCAGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    572 AGTTCTCCCACCGCTCTGGCCGTGACCTCATTAACTTGGCCAAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102970 AGTTCTCCCACCGCTCTGGCCGTGACCTCATTAACTTGGCCAAGAAGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    622 ACCAACATCATTCCTGTGATCGAGGATGCTCGACACCCACACAAATACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103020 ACCAACATCATTCCTGTGATCGAGGATGCTCGACACCCACACAAATACCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    672 CATGCTCATCG         CAATGGTGGATGTGATCTTTGCTGATGTGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 CATGCTCATCGGTG...TAGCAATGGTGGATGTGATCTTTGCTGATGTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    713 CCCAGCCAGACCAGACCCGGATTGTGGCCCTGAATGCCCACACCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104153 CCCAGCCAGACCAGACCCGGATTGTGGCCCTGAATGCCCACACCTTCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    763 CGTAATGGAGGACACTTTGTGATTTCCATTAAG         GCCAACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104203 CGTAATGGAGGACACTTTGTGATTTCCATTAAGGTG...TAGGCCAACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    804 CATTGACTCCACAGCCTCAGCCGAGGCCGTGTTTGCCTCCGAAGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105986 CATTGACTCCACAGCCTCAGCCGAGGCCGTGTTTGCCTCCGAAGTGAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    854 AGATGCAACAGGAGAACATGAAGCCGCAGGAGCAGTTGACCCTTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106036 AGATGCAACAGGAGAACATGAAGCCGCAGGAGCAGTTGACCCTTGAGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    904 TATGAAAGAGACCATGCCGTGGTCGTGGGAGTGTACAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106086 TATGAAAGAGACCATGCCGTGGTCGTGGGAGTGTACAGGTG...CAGGCC

   1000     .    :    .
    945 ACCCCCCAAGGTGAAGAAC
        |||||||||||||||||||
 106232 ACCCCCCAAGGTGAAGAAC