seq1 = pF1KB8262.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB8262/gi568815583r_90130934.tfa (gi568815583r:90130934_90333885), 202952 bp

>pF1KB8262 573
>gi568815583r:90130934_90333885 (Chr15)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-86  (100183-100217)   100% ->
87-195  (101559-101667)   100% ->
196-346  (102379-102529)   100% ->
347-465  (102673-102791)   100% ->
466-554  (102864-102952)   100% ->
555-573  (103381-103399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGGCTCGGGCAGTCGCCTGTCCAAGGAGCTGCTGGCCGAGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGGCTCGGGCAGTCGCCTGTCCAAGGAGCTGCTGGCCGAGTACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GACTTGACGTTCCTGACGAAGCAGGAGATCCTCCT     
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100051 GGTG...CAGGACTTGACGTTCCTGACGAAGCAGGAGATCCTCCTGTA..

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     87     AGCCCACAGGCGGTTTTGTGAGCTGCTTCCCCAGGAGCAGCGGAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100223 .CAGAGCCCACAGGCGGTTTTGTGAGCTGCTTCCCCAGGAGCAGCGGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGGAGTCGTCACTTCGGGCACAAGTGCCCTTCGAGCAGATTCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101605 GTGGAGTCGTCACTTCGGGCACAAGTGCCCTTCGAGCAGATTCTCAGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCAGAGCTCAAG         GCCAACCCCTTCAAGGAGCGAATCTGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101655 TCCAGAGCTCAAGGTG...TAGGCCAACCCCTTCAAGGAGCGAATCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGGTCTTCTCCACATCCCCAGCCAAAGACAGCCTTAGCTTTGAGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102407 GGGTCTTCTCCACATCCCCAGCCAAAGACAGCCTTAGCTTTGAGGACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGATCTCCTCAGTGTGTTCAGTGACACAGCCACGCCAGACATCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102457 CTGGATCTCCTCAGTGTGTTCAGTGACACAGCCACGCCAGACATCAAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCATTATGCCTTCCGCATCTTTG         ACTTTGATGATGACGGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102507 CCATTATGCCTTCCGCATCTTTGGTG...TAGACTTTGATGATGACGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCTTGAACAGAGAAGACCTGAGCCGGCTGGTGAACTGCCTCACGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102691 CCTTGAACAGAGAAGACCTGAGCCGGCTGGTGAACTGCCTCACGGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCGAGGACACACGGCTTAGTGCGTCTGAGATGAAGCAGCTCATCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102741 GGCGAGGACACACGGCTTAGTGCGTCTGAGATGAAGCAGCTCATCGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 C         ATCCTGGAGGAGTCTGACATTGACAGGGATGGAACCATCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102791 CGTG...CAGATCCTGGAGGAGTCTGACATTGACAGGGATGGAACCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCTCTCTGAGTTCCAGCACGTCATCTCCCGTTCTCCAGACTTTGCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102904 ACCTCTCTGAGTTCCAGCACGTCATCTCCCGTTCTCCAGACTTTGCCAGG

    600     .    :    .    :    .
    555         CTCCTTTAAGATTGTCCTG
        >>...>>>|||||||||||||||||||
 102954 TA...CAGCTCCTTTAAGATTGTCCTG