seq1 = pF1KB8261.tfa, 465 bp
seq2 = pF1KB8261/gi568815582f_2414104.tfa (gi568815582f:2414104_2619742), 205639 bp

>pF1KB8261 465
>gi568815582f:2414104_2619742 (Chr16)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-263  (105115-105298)   100% ->
264-465  (105438-105639)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGAGTCCAAGAGCGGCCCCGAGTATGCTTCGTTTTTCGCCGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGAGTCCAAGAGCGGCCCCGAGTATGCTTCGTTTTTCGCCGTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGCCTCGGCCGCCATGGTCTTCAGCG         CCCTGGGCGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GGGCGCCTCGGCCGCCATGGTCTTCAGCGGTG...CAGCCCTGGGCGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTATGGCACAGCCAAGAGCGGTACCGGCATTGCGGCCATGTCTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105127 CCTATGGCACAGCCAAGAGCGGTACCGGCATTGCGGCCATGTCTGTCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGCCGGAGCAGATCATGAAGTCCATCATCCCAGTGGTCATGGCTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105177 CGGCCGGAGCAGATCATGAAGTCCATCATCCCAGTGGTCATGGCTGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCGCCATCTACGGCCTGGTGGTGGCAGTCCTCATCGCCAACTCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105227 CATCGCCATCTACGGCCTGGTGGTGGCAGTCCTCATCGCCAACTCCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGACGACATCAGCCTCTACAA         GAGCTTCCTCCAGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105277 ATGACGACATCAGCCTCTACAAGTG...CAGGAGCTTCCTCCAGCTGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105457 GCCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105507 CATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCGTGGGCATGATCCTGATTCTCATCTTCGCCGAGGTGCTCGGCCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105557 TCGTGGGCATGATCCTGATTCTCATCTTCGCCGAGGTGCTCGGCCTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :
    433 GGTCTCATCGTCGCCCTCATCCTCTCCACAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 GGTCTCATCGTCGCCCTCATCCTCTCCACAAAG