seq1 = pF1KB8260.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KB8260/gi568815578r_3654061.tfa (gi568815578r:3654061_3860100), 206040 bp

>pF1KB8260 597
>gi568815578r:3654061_3860100 (Chr20)

(complement)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-237  (101423-101565)   100% ->
238-376  (104494-104632)   100% ->
377-499  (105582-105704)   100% ->
500-597  (105943-106040)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAGCCAACAAGGGTAAGTGCCTTCCTGGCGTGGTAGGACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAGCCAACAAGGGTAAGTGCCTTCCTGGCGTGGTAGGACTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAAGCTCTTCCGGTGGGCCCTGGTAGGAGGGCCATTGCTGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 ACAAGCTCTTCCGGTGGGCCCTGGTAGGAGGGCCATTGCTGCAGGTA...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    GCAACAAGCCCAGAGTCCGGAGTATCCGCTTTGCGGCAGGCCACGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101420 TAGGCAACAAGCCCAGAGTCCGGAGTATCCGCTTTGCGGCAGGCCACGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGAAGGATCCCACAGCCACGTCCACTTTGATGAGAAGCTGCATGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101470 GCAGAAGGATCCCACAGCCACGTCCACTTTGATGAGAAGCTGCATGACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGGTCATGGTCACCCAGGAGAGTGACAGCAGCTTTCTGGTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101520 GGTGGTCATGGTCACCCAGGAGAGTGACAGCAGCTTTCTGGTCAAGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238      GTTGGCTTCCTGAAGATCCTGCACAGGTATGAGATTACCTTCACT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101570 ..TAGGTTGGCTTCCTGAAGATCCTGCACAGGTATGAGATTACCTTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCCCCCAGTGCACAGGCTGAGCAAGGATGTCCGCGAGGCACCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104539 CTGCCCCCAGTGCACAGGCTGAGCAAGGATGTCCGCGAGGCACCTGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGCCTGCACCTCAAGCTCCTCAGCGTGGTGCCCGTCCCTGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104589 CAGCCTGCACCTCAAGCTCCTCAGCGTGGTGCCCGTCCCTGAAGGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    377    GTTATAGTGTCAAGTGTGAGTACTCGGCGCACAAAGAGGGCGTCCTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105579 CAGGTTATAGTGTCAAGTGTGAGTACTCGGCGCACAAAGAGGGCGTCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAGAGGAGATACTGCTAGCCTGCGAAGGTGGCACTGGCACCTGTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105629 AAAGAGGAGATACTGCTAGCCTGCGAAGGTGGCACTGGCACCTGTGTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGTGACGGTGCAGGCCCGCGTCATGG         ACCGGCACCACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105679 CGTGACGGTGCAGGCCCGCGTCATGGGTG...CAGACCGGCACCACGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGCCCATGCTGCTGGATGGTGTCAAGTGTGTGGGCGCCGAGCTGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105958 CGCCCATGCTGCTGGATGGTGTCAAGTGTGTGGGCGCCGAGCTGGAATAC

    600     .    :    .    :    .    :
    565 GACTCAGAGCACAGCGACTGGCACGGCTTTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 106008 GACTCAGAGCACAGCGACTGGCACGGCTTTGAC