seq1 = pF1KB8256.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB8256/gi568815587r_62707472.tfa (gi568815587r:62707472_62931243), 223772 bp

>pF1KB8256 1065
>gi568815587r:62707472_62931243 (Chr11)

(complement)

1-225  (100001-100225)   100% ->
226-296  (103613-103683)   100% ->
297-352  (103846-103901)   100% ->
353-423  (104019-104089)   100% ->
424-540  (105705-105821)   100% ->
541-597  (105905-105961)   100% ->
598-679  (106127-106208)   100% ->
680-786  (106679-106785)   100% ->
787-908  (106957-107078)   100% ->
909-1065  (123616-123772)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCCGCGGAAACGCTACGGGTCTAAGAACACGGATCAGGGTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCCGCGGAAACGCTACGGGTCTAAGAACACGGATCAGGGTGTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGTCTCTCAAAGACACAGGTCCTGTCCCCTGCAACTGCTGGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGTCTCTCAAAGACACAGGTCCTGTCCCCTGCAACTGCTGGCAGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCAGCGACATCGCCCCTCTGCCCCCCCCAGTGACCCTCGTCCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGCAGCGACATCGCCCCTCTGCCCCCCCCAGTGACCCTCGTCCCTCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTCCCGACACCATGTCCTGCCGGGATCGGACCCAGGAGTTTCTGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTCCCGACACCATGTCCTGCCGGGATCGGACCCAGGAGTTTCTGTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCAAGTCGCTGCAGACCCGTCAG         AATGGAATCCAGACAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100201 CTGCAAGTCGCTGCAGACCCGTCAGGTA...CAGAATGGAATCCAGACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATAAGCCAGCTTTGCGTGCTGTCCGACAACGCAGTGAATTCACCCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103629 ATAAGCCAGCTTTGCGTGCTGTCCGACAACGCAGTGAATTCACCCTCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCAA         GCGCATTGGGAAAGACCTTAGCAACACATTTGCCAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103679 GCCAAGTG...CAGGCGCATTGGGAAAGACCTTAGCAACACATTTGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGGAGAAGCTGACAATCT         TGGCAAAGCGCAAGTCCCTCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103882 GCTGGAGAAGCTGACAATCTGTG...TAGTGGCAAAGCGCAAGTCCCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGATGATAAAGCAGTGGAAATTGAAGAGCTAACATATATCATCAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104040 TTGATGATAAAGCAGTGGAAATTGAAGAGCTAACATATATCATCAAACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          GACATCAATAGCCTCAACAAACAAATTGCTCAGCTCCAGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104090 GTG...CAGGACATCAATAGCCTCAACAAACAAATTGCTCAGCTCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCGTGAGAGCCAAGGGCAGCCAGAGTGGCCGGCACCTGCAGACCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105746 TTTCGTGAGAGCCAAGGGCAGCCAGAGTGGCCGGCACCTGCAGACCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAACACCATTGTGGTCTCCTTGCAG         TCGAAACTGGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105796 CCAACACCATTGTGGTCTCCTTGCAGGTG...TAGTCGAAACTGGCTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGTCCAATGACTTCAAATCGGTTTTAGAAGTGAGGACAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105920 ATGTCCAATGACTTCAAATCGGTTTTAGAAGTGAGGACAGAGGTG...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598  AACCTGAAGCAGCAGAGGAGCCGGAGAGAGCAGTTCTCCCGGGCACCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106126 GAACCTGAAGCAGCAGAGGAGCCGGAGAGAGCAGTTCTCCCGGGCACCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGTCAGCCCTGCCCCTTGCCCCTAACCACCTGG         GCGGTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106176 TGTCAGCCCTGCCCCTTGCCCCTAACCACCTGGGTA...CAGGCGGTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCTGTGGTTCTGGGGGCAGAGTCCCATGCCTCCAAGGATGTCGCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106687 GCTGTGGTTCTGGGGGCAGAGTCCCATGCCTCCAAGGATGTCGCCATCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATGATGGACTCTCGGACCAGCCAGCAGCTGCAGCTCATTGACGAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106737 CATGATGGACTCTCGGACCAGCCAGCAGCTGCAGCTCATTGACGAGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787         GATTCCTACATCCAGAGTCGGGCAGACACCATGCAGAACATT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106787 TA...AAGGATTCCTACATCCAGAGTCGGGCAGACACCATGCAGAACATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAGTCGACAATTGTTGAGTTGGGCTCCATCTTTCAGCAGTTGGCACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106999 GAGTCGACAATTGTTGAGTTGGGCTCCATCTTTCAGCAGTTGGCACACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGTTAAGGAACAGGAGGAAACCATTCAGAG         GATCGACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107049 GGTTAAGGAACAGGAGGAAACCATTCAGAGGTG...CAGGATCGACGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACGTGCTAGGAGCCCAGCTGGACGTTGAGGCCGCCCATTCAGAGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123627 ACGTGCTAGGAGCCCAGCTGGACGTTGAGGCCGCCCATTCAGAGATCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGTACTTCCAGTCTGTCACCTCCAACCGGTGGCTCATGGTCAAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123677 AAGTACTTCCAGTCTGTCACCTCCAACCGGTGGCTCATGGTCAAAATCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1020 CCTCATCCTCATTGTCTTCTTCATCATCTTTGTGGTCTTCCTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123727 CCTCATCCTCATTGTCTTCTTCATCATCTTTGTGGTCTTCCTTGCT