seq1 = pF1KB8254.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KB8254/gi568815591f_6287211.tfa (gi568815591f:6287211_6502443), 215233 bp

>pF1KB8254 576
>gi568815591f:6287211_6502443 (Chr7)

1-35  (87526-87560)   100% ->
36-107  (100002-100073)   100% ->
108-225  (104714-104831)   100% ->
226-288  (112916-112978)   100% ->
289-448  (114658-114817)   100% ->
449-576  (115106-115233)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGCCATCAAGTGTGTGGTGGTGGGAGACGG         AGCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  87526 ATGCAGGCCATCAAGTGTGTGGTGGTGGGAGACGGGTG...TAGAGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGGTAAAACTTGCCTACTGATCAGTTACACAACCAATGCATTTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100008 AGGTAAAACTTGCCTACTGATCAGTTACACAACCAATGCATTTCCTGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATATATCCCTACTGT         CTTTGACAATTATTCTGCCAATGTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100058 AATATATCCCTACTGTGTA...CAGCTTTGACAATTATTCTGCCAATGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATGGTAGATGGAAAACCGGTGAATCTGGGCTTATGGGATACAGCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104739 ATGGTAGATGGAAAACCGGTGAATCTGGGCTTATGGGATACAGCTGGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAGATTATGACAGATTACGCCCCCTATCCTATCCGCAAACA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104789 AGAAGATTATGACAGATTACGCCCCCTATCCTATCCGCAAACAGTA...T

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   GATGTGTTCTTAATTTGCTTTTCCCTTGTGAGTCCTGCATCATTTGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112914 AGGATGTGTTCTTAATTTGCTTTTCCCTTGTGAGTCCTGCATCATTTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AATGTCCGTGCAAAG         TGGTATCCTGAGGTGCGGCACCACTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112964 AATGTCCGTGCAAAGGTA...TAGTGGTATCCTGAGGTGCGGCACCACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TCCCAACACTCCCATCATCCTAGTGGGAACTAAACTTGATCTTAGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114684 TCCCAACACTCCCATCATCCTAGTGGGAACTAAACTTGATCTTAGGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATAAAGACACGATCGAGAAACTGAAGGAGAAGAAGCTGACTCCCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114734 ATAAAGACACGATCGAGAAACTGAAGGAGAAGAAGCTGACTCCCATCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TATCCGCAGGGTCTAGCCATGGCTAAGGAGATTG         GTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114784 TATCCGCAGGGTCTAGCCATGGCTAAGGAGATTGGTA...TAGGTGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAAATACCTGGAGTGCTCGGCGCTCACACAGCGAGGCCTCAAGACAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115113 AAAATACCTGGAGTGCTCGGCGCTCACACAGCGAGGCCTCAAGACAGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGACGAAGCGATCCGAGCAGTCCTCTGCCCGCCTCCCGTGAAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115163 TTGACGAAGCGATCCGAGCAGTCCTCTGCCCGCCTCCCGTGAAGAAGAGG

    600     .    :    .    :
    556 AAGAGAAAATGCCTGCTGTTG
        |||||||||||||||||||||
 115213 AAGAGAAAATGCCTGCTGTTG