seq1 = pF1KB8249.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KB8249/gi568815586r_122108384.tfa (gi568815586r:122108384_122326014), 217631 bp

>pF1KB8249 717
>gi568815586r:122108384_122326014 (Chr12)

(complement)

1-50  (100001-100050)   100% ->
51-183  (101371-101503)   100% ->
184-315  (107618-107749)   100% ->
316-426  (109146-109256)   100% ->
427-523  (109431-109527)   100% ->
524-717  (117438-117631)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTCTGAAGAGTTGGCTGTCGCGCAGCGTAACTTCATTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTCTGAAGAGTTGGCTGTCGCGCAGCGTAACTTCATTCTTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51          GTACAGACAGTGTTTGTGTGTTCCTGTTGTGGCTAACTTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTA...CAGGTACAGACAGTGTTTGTGTGTTCCTGTTGTGGCTAACTTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAGCGGTGTTTCTCAGAATTGATAAGACCATGGCACAAAACTGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101412 AGAAGCGGTGTTTCTCAGAATTGATAAGACCATGGCACAAAACTGTGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGGCTTTGGAGTAACCCTGTGTGCGGTTCCTATTGCACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101462 ATTGGCTTTGGAGTAACCCTGTGTGCGGTTCCTATTGCACAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  AAATCAGAGCCTCATTCCCTTAGTAGTGAAGCATTGATGAGGAGAGCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107617 GAAATCAGAGCCTCATTCCCTTAGTAGTGAAGCATTGATGAGGAGAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTCTTTGGTAACAGATAGCACCTCTACCTTTCTCTCTCAGACCACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107667 TGTCTTTGGTAACAGATAGCACCTCTACCTTTCTCTCTCAGACCACATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCGTTGATTGAAGCTATTACTGAATATACTAAG         GCTGTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107717 GCGTTGATTGAAGCTATTACTGAATATACTAAGGTA...TAGGCTGTTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TACCTTAACTTCTCTTTACCGACAATATACAAGTTTACTTGGGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109154 TACCTTAACTTCTCTTTACCGACAATATACAAGTTTACTTGGGAAAATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTCAGAGGAGGAAGATGAAGTGTGGCAGGTGATCATAGGAGCCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109204 ATTCAGAGGAGGAAGATGAAGTGTGGCAGGTGATCATAGGAGCCAGAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAG         ATGACTTCAAAACACCAAGAGTACTTGAAGCTGGAAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109254 GAGGTA...TAGATGACTTCAAAACACCAAGAGTACTTGAAGCTGGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACTTGGATGACTGCAGTTGGTCTTTCAGAGATGGCAGCAGAAGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109469 CACTTGGATGACTGCAGTTGGTCTTTCAGAGATGGCAGCAGAAGCTGCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCAAACTG         GCGCAGATCAGGCCTCTATAACCGCCAGGAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109519 ATCAAACTGGTA...CAGGCGCAGATCAGGCCTCTATAACCGCCAGGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACATTCAGCTGGTGAAACTGCAGGTGGAAGAGGTGCACCAGCTCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117470 CACATTCAGCTGGTGAAACTGCAGGTGGAAGAGGTGCACCAGCTCTCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAAGCAGAAACCAAGCTGGCAGAAGCACAGATAGAAGAGCTCCGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117520 GAAAGCAGAAACCAAGCTGGCAGAAGCACAGATAGAAGAGCTCCGTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAACACAGGAGGAAGGGGAGGAGCGGGCTGAGTCGGAGCAGGAGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117570 AAACACAGGAGGAAGGGGAGGAGCGGGCTGAGTCGGAGCAGGAGGCCTAC

    750     .    :
    706 CTGCGTGAGGAT
        ||||||||||||
 117620 CTGCGTGAGGAT