seq1 = pF1KB8248.tfa, 705 bp
seq2 = pF1KB8248/gi568815579r_41286636.tfa (gi568815579r:41286636_41497328), 210693 bp

>pF1KB8248 705
>gi568815579r:41286636_41497328 (Chr19)

(complement)

1-148  (100001-100148)   100% ->
149-262  (104349-104462)   100% ->
263-384  (105367-105488)   100% ->
385-525  (107424-107564)   100% ->
526-615  (109726-109815)   100% ->
616-705  (110604-110693)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGGAGACGCATACTGACGCCAAAATCCGTGCTGAAAATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGGAGACGCATACTGACGCCAAAATCCGTGCTGAAAATGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGTCCAGCCCTCGGGGTCCTGGCTGCAGCCTCCGGCACTTTGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGTCCAGCCCTCGGGGTCCTGGCTGCAGCCTCCGGCACTTTGCCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACAGAACCTGCTGTCGCGGCCAGATGGCTCTGCTTCCTTCCTGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 AACAGAACCTGCTGTCGCGGCCAGATGGCTCTGCTTCCTTCCTGCAAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        GTGACACCTCTGTCCTGGCGGGTGTGTACGGGCCGGCCGAGGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 A...CAGGTGACACCTCTGTCCTGGCGGGTGTGTACGGGCCGGCCGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGTCAGCAAAGAGATTTTCAACAAGGCCACACTCGAAGTGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104392 GAAGGTCAGCAAAGAGATTTTCAACAAGGCCACACTCGAAGTGATCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCCGAAGATTGGGCTGCCTG         GTGTTGCAGAGAAGAGCCGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104442 GGCCGAAGATTGGGCTGCCTGGTA...CAGGTGTTGCAGAGAAGAGCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCGGCTGATCAGGAACACGTGCGAGGCGGTGGTGCTGGGCACGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105387 GAGCGGCTGATCAGGAACACGTGCGAGGCGGTGGTGCTGGGCACGTTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCCGCACCTCCATCACCGTGGTGCTGCAGGTTGTCAGCGATGCCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105437 CCCCCGCACCTCCATCACCGTGGTGCTGCAGGTTGTCAGCGATGCCGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CT         CTCCTGGCCTGTTGTCTGAATGCCGCCTGCATGGCATTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105487 CTGTA...CAGCTCCTGGCCTGTTGTCTGAATGCCGCCTGCATGGCATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGATGCAGGTGTGCCCATGCGGGCTCTCTTCTGTGGGGTCGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107463 GTGGATGCAGGTGTGCCCATGCGGGCTCTCTTCTGTGGGGTCGCCTGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGACTCTGATGGGACCCTCGTGCTGGATCCTACATCCAAGCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107513 CCTGGACTCTGATGGGACCCTCGTGCTGGATCCTACATCCAAGCAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         GAGGCCCGGGCAGTCCTGACCTTTGCCCTGGACAGCGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107563 AGGTA...TAGGAGGCCCGGGCAGTCCTGACCTTTGCCCTGGACAGCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAACGGAAGCTGCTGATGTCCAGCACCAAGGGGCTCTACTCAGACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109765 GAACGGAAGCTGCTGATGTCCAGCACCAAGGGGCTCTACTCAGACACTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 G         CTCCAGCAGTGCCTGGCTGCGGCCCAGGCCGCTTCGCAAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109815 GGTA...CAGCTCCAGCAGTGCCTGGCTGCGGCCCAGGCCGCTTCGCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACGTCTTCCGTTTCTACCGGGAATCGCTGCAGAGGCGTTACTCCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110644 ACGTCTTCCGTTTCTACCGGGAATCGCTGCAGAGGCGTTACTCCAAGAGC