seq1 = pF1KB8239.tfa, 423 bp
seq2 = pF1KB8239/gi568815589r_136762459.tfa (gi568815589r:136762459_136966258), 203800 bp

>pF1KB8239 423
>gi568815589r:136762459_136966258 (Chr9)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-130  (102388-102439)   100% ->
131-291  (102811-102971)   100% ->
292-385  (103260-103353)   100% ->
386-423  (103763-103800)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGAGCGACTGGGACACGGTGACGGTGCTGCGCAAGAAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGAGCGACTGGGACACGGTGACGGTGCTGCGCAAGAAGGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACGGCCGCCCAGGCCAAATCCAAGCAG         GCTATCTTAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 TACGGCCGCCCAGGCCAAATCCAAGCAGGTG...TAGGCTATCTTAGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACAGAGACGAGGAGAAGATGTGGAGACTTCCAAGAAAT         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102401 CACAGAGACGAGGAGAAGATGTGGAGACTTCCAAGAAATGTA...CAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCTGCTGGCCAGAACAAACAACATTCTATTACCAAGAACACGGCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102813 GCTGCTGGCCAGAACAAACAACATTCTATTACCAAGAACACGGCCAAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACCGGGAGACAGAGGAGCTGCACCATGACAGGGTGACCCTGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102863 GGACCGGGAGACAGAGGAGCTGCACCATGACAGGGTGACCCTGGAGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAAGGTGATCCAGCAAGGTCGGCAGAGCAAGGGGCTTACGCAGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102913 GCAAGGTGATCCAGCAAGGTCGGCAGAGCAAGGGGCTTACGCAGAAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGCCACG         AAAATCAATGAGAAGCCACAGGTGATCGCGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102963 CTGGCCACGGTG...TAGAAAATCAATGAGAAGCCACAGGTGATCGCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTATGAGAGCGGACGGGCCATACCCAATAACCAGGTGCTTGGCAAAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 CTATGAGAGCGGACGGGCCATACCCAATAACCAGGTGCTTGGCAAAATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCGGGCCATTG         ATGTGGGAACCAGGAGTGCTCGTGTGCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103342 AGCGGGCCATTGGTG...TAGATGTGGGAACCAGGAGTGCTCGTGTGCTG

    450     .
    415 AGAGCCCAG
        |||||||||
 103792 AGAGCCCAG