seq1 = pF1KB8233.tfa, 447 bp
seq2 = pF1KB8233/gi568815597r_25801019.tfa (gi568815597r:25801019_26003814), 202796 bp

>pF1KB8233 447
>gi568815597r:25801019_26003814 (Chr1)

(complement)

9-186  (99996-100174)   99% ->
187-378  (102133-102324)   100% ->
379-447  (102728-102796)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      9 TTCT GATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCT
        ||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 TTCTAGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 TTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCTGTTCCAGAATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 TTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCTGTTCCAGAATTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 CCTTTCCCCTCCAAAGAAGAAGGATCTTTCCCTGGAGGAAATTCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100096 CCTTTCCCCTCCAAAGAAGAAGGATCTTTCCCTGGAGGAAATTCAGAAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 AATTAGAAGCTGCAGAAGAAAGACGCAAG         TCCCATGAAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100146 AATTAGAAGCTGCAGAAGAAAGACGCAAGGTA...CAGTCCCATGAAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 GAGGTCTTGAAGCAGCTGGCTGAGAAACGAGAGCACGAGAAAGAAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102145 GAGGTCTTGAAGCAGCTGGCTGAGAAACGAGAGCACGAGAAAGAAGTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 TCAGAAGGCAATAGAAGAGAACAACAACTTCAGTAAAATGGCAGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102195 TCAGAAGGCAATAGAAGAGAACAACAACTTCAGTAAAATGGCAGAAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 AACTGACCCACAAAATGGAAGCTAATAAAGAGAACCGAGAGGCACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102245 AACTGACCCACAAAATGGAAGCTAATAAAGAGAACCGAGAGGCACAAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349 GCTGCCAAACTGGAACGTTTGCGAGAGAAG         GATAAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102295 GCTGCCAAACTGGAACGTTTGCGAGAGAAGGTT...CAGGATAAGCACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 TGAAGAAGTGCGGAAGAACAAAGAATCCAAAGACCCTGCTGACGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102739 TGAAGAAGTGCGGAAGAACAAAGAATCCAAAGACCCTGCTGACGAGACTG

    450     .
    440 AAGCTGAC
        ||||||||
 102789 AAGCTGAC