seq1 = pF1KB8224.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KB8224/gi568815579r_54007053.tfa (gi568815579r:54007053_54214701), 207649 bp

>pF1KB8224 759
>gi568815579r:54007053_54214701 (Chr19)

(complement)

1-23  (99433-99455)   100% ->
24-282  (100002-100260)   100% ->
283-353  (104581-104651)   100% ->
354-423  (106307-106376)   100% ->
424-642  (106458-106676)   100% ->
643-759  (107533-107649)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATTGGAGCAGAGAGAAGG         GACCATGGCAGCCGTGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  99433 ATGGAATTGGAGCAGAGAGAAGGGTA...CAGGACCATGGCAGCCGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTTGAGGAGTTCTCAGCGCCGCCAGGCTCAGAGTTGGCGTTGCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 CTTTGAGGAGTTCTCAGCGCCGCCAGGCTCAGAGTTGGCGTTGCCTCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TATTTGGTGGCCACATCCTGGAGAGCGAGCTGGAGACGGAAGTGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 TATTTGGTGGCCACATCCTGGAGAGCGAGCTGGAGACGGAAGTGGAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTCAGGTGGTCTGGGCGGCTCAGGGCTCCGGGAGCGAGATGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100120 GTGTCAGGTGGTCTGGGCGGCTCAGGGCTCCGGGAGCGAGATGAAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGGCAGCCCGGGGTCGGCGGCGGCGCCAGCGGGAATTAAATCGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 AGAGGCAGCCCGGGGTCGGCGGCGGCGCCAGCGGGAATTAAATCGCAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTACCAGGCACTAGGTCGGCGCTGCCGGGAGATCGAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100220 AGTACCAGGCACTAGGTCGGCGCTGCCGGGAGATCGAGCAGGTA...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGAACGAGCGGGTCCTGAACAGGCTCCATCAGGTGCAGAGGATAACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104581 GTGAACGAGCGGGTCCTGAACAGGCTCCATCAGGTGCAGAGGATAACTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGGCTGCAGCAGGAACGGAG         GTTCCTCATGAGAGTGCTGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104631 GAGGCTGCAGCAGGAACGGAGGTA...CAGGTTCCTCATGAGAGTGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTCCTACGGGGATGACTACCGGGCCAGCCAGTTCACCATTGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106327 ACTCCTACGGGGATGACTACCGGGCCAGCCAGTTCACCATTGTGCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          GATGAGGGCAGCCAGGGCACGGATGCCCCCACCCCAGGCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106377 GTG...CAGGATGAGGGCAGCCAGGGCACGGATGCCCCCACCCCAGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCGGAGAATGAGCCTCCAGAGAAAGAGACACTGTCCCCGCCCAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106499 TGCGGAGAATGAGCCTCCAGAGAAAGAGACACTGTCCCCGCCCAGAAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTCCTGCACCCCCAGAACCCGGCAGCCCAGCCCCCGGTGAGGGGCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106549 CTCCTGCACCCCCAGAACCCGGCAGCCCAGCCCCCGGTGAGGGGCCCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGCGGAAGAGGCGGCGAGTGCCACGGGATGGACGCCGAGCAGGAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106599 GGGCGGAAGAGGCGGCGAGTGCCACGGGATGGACGCCGAGCAGGAAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGACTCCAGAGCTGGCCCCGGTGCAG         ATTAAGGTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106649 GCTGACTCCAGAGCTGGCCCCGGTGCAGGTG...CAGATTAAGGTTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGACTTTGGCTTTGAAGCAGATGAGGCCCTGGATTCCAGTTGGGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107546 AAGACTTTGGCTTTGAAGCAGATGAGGCCCTGGATTCCAGTTGGGTTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGGGGTCCAGACAAACTGCTGCCCTACCCGACCCTGGCCAGCCCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107596 CGGGGTCCAGACAAACTGCTGCCCTACCCGACCCTGGCCAGCCCAGCCTC

    800 
    756 TGAC
        ||||
 107646 TGAC