seq1 = pF1KB8221.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KB8221/gi568815589f_36091057.tfa (gi568815589f:36091057_36311771), 220715 bp

>pF1KB8221 744
>gi568815589f:36091057_36311771 (Chr9)

1-217  (100001-100217)   100% ->
218-255  (106495-106532)   100% ->
256-373  (107923-108040)   100% ->
374-485  (113012-113123)   100% ->
486-539  (118211-118264)   100% ->
540-575  (119569-119604)   100% ->
576-744  (120547-120715)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGCTGGATCCGTTCGGCGCCCCTGCCGGCGCCCCTGGCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGCTGGATCCGTTCGGCGCCCCTGCCGGCGCCCCTGGCGGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCTGGGGAACGGAGTGGCCGGCGCCGGCGAAGAAGACCCGGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGCTGGGGAACGGAGTGGCCGGCGCCGGCGAAGAAGACCCGGCTGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCTTGGCGCAGCAAGAGAGCGAGATTGCGGGCATCGAGAACGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCTTGGCGCAGCAAGAGAGCGAGATTGCGGGCATCGAGAACGACGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTCGCCATCCTGGACGGCGGCGCCCCCGGGCCCCAGCCGCACGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTCGCCATCCTGGACGGCGGCGCCCCCGGGCCCCAGCCGCACGGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCGCCGGGGGGTCCGG         ATGCTGTTGATGGAGTAATGAATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCGCCGGGGGGTCCGGGTG...CAGATGCTGTTGATGGAGTAATGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGAATACTACCAG         GAAAGTAATGGTCCAACAGACAGTTAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106519 GTGAATACTACCAGGTA...AAGGAAAGTAATGGTCCAACAGACAGTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGCTATTTCACAAGTGGATCGATTGCAGTCAGAGCCTGAAAGTATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107950 GCAGCTATTTCACAAGTGGATCGATTGCAGTCAGAGCCTGAAAGTATCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAATGGAGAGAAGAACAAATGGAACGCTTGGAAGCCCTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108000 TAAATGGAGAGAAGAACAAATGGAACGCTTGGAAGCCCTTGGTA...AAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGCCAATTCTCGGAAGCAAGAAGCAGAGTGGAAAGAAAAGGCAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113012 ATGCCAATTCTCGGAAGCAAGAAGCAGAGTGGAAAGAAAAGGCAATAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCTAGAAGAATGGTATGCAAGACAGGACGAGCAGCTACAGAAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113062 GAGCTAGAAGAATGGTATGCAAGACAGGACGAGCAGCTACAGAAAACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCAAACAACAG         GGTGGCAGATGAAGCTTTCTACAAACAAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113112 AGCAAACAACAGGTC...TAGGGTGGCAGATGAAGCTTTCTACAAACAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTTCGCTGACGTGATTGGTTATGT         CACAAACATAAACCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 118240 CCTTCGCTGACGTGATTGGTTATGTGTA...AAGCACAAACATAAACCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCTTGCTACAGCCTAGAACA         GGCAGCAGAAGAAGCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 119585 CCTTGCTACAGCCTAGAACAGTT...CAGGGCAGCAGAAGAAGCCTTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AAATGACATTGACGAGTCGTCCCCAGGCACTGAGTGGGAACGGGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120568 AAATGACATTGACGAGTCGTCCCCAGGCACTGAGTGGGAACGGGTGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGCTGTGTGACTTTAACCCCAAGTCTAGCAAGCAGGCCAAAGATGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120618 GGCTGTGTGACTTTAACCCCAAGTCTAGCAAGCAGGCCAAAGATGTCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    697 CGCATGCGCTCAGTCCTCATCTCCCTCAAGCAGGCCCCGCTGGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120668 CGCATGCGCTCAGTCCTCATCTCCCTCAAGCAGGCCCCGCTGGTGCAC