seq1 = pF1KB8218.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KB8218/gi568815594f_4287630.tfa (gi568815594f:4287630_4517432), 229803 bp

>pF1KB8218 555
>gi568815594f:4287630_4517432 (Chr4)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-246  (103846-103962)   100% ->
247-357  (121944-122054)   100% ->
358-555  (129606-129803)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAGTTGGGGAACAATTTCGCAGAGAAGGGCACCAAGCAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAAGTTGGGGAACAATTTCGCAGAGAAGGGCACCAAGCAGCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGAGGATGGCTTCGACACCATTCCCCTGATGACGCCCCTCGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGAGGATGGCTTCGACACCATTCCCCTGATGACGCCCCTCGATGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCAGCTGCAGTTCCCGCCCCCGGATAAG         GTGGTCGTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 ATCAGCTGCAGTTCCCGCCCCCGGATAAGGTA...AAGGTGGTCGTGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTAAGACCGAGTATGAACCTGACCGCAAGAAAGGGAAAGCACGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103858 ACTAAGACCGAGTATGAACCTGACCGCAAGAAAGGGAAAGCACGTCCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAAATTGCTGAGTTCACCGTCAGCATCACGGAGGGTGTCACCGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103908 CCAAATTGCTGAGTTCACCGTCAGCATCACGGAGGGTGTCACCGAGAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTAAG         GTCTCCGTGTTGGTCCTCTTCGCCCTGGCCTTCCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103958 TTAAGGTG...CAGGTCTCCGTGTTGGTCCTCTTCGCCCTGGCCTTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTGCGTCGTCTTCCTGGTTGTCTACAAGGTGTACAAGTATGACCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121980 ACCTGCGTCGTCTTCCTGGTTGTCTACAAGGTGTACAAGTATGACCGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTGCCCCGATGGGTTCGTCCTCAAG         AACACCCAGTGCATCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 122030 CTGCCCCGATGGGTTCGTCCTCAAGGTA...CAGAACACCCAGTGCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGAAGGCTTGGAGAGCTACTACGCGGAGCAAGACTCCAGTGCCCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129622 CAGAAGGCTTGGAGAGCTACTACGCGGAGCAAGACTCCAGTGCCCGGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAATTTTACACAGTCATAAACCACTACAACCTGGCCAAGCAGAGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129672 AAATTTTACACAGTCATAAACCACTACAACCTGGCCAAGCAGAGCATCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCGCTCCGTATCGCCCTGGATGTCAGTTCTGTCAGAAGAGAAGCTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129722 GCGCTCCGTATCGCCCTGGATGTCAGTTCTGTCAGAAGAGAAGCTGTCCG

    550     .    :    .    :    .    :
    524 AGCAGGAGACTGAAGCGGCTGAGAAGTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 129772 AGCAGGAGACTGAAGCGGCTGAGAAGTCAGCT