seq1 = pF1KB8216.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KB8216/gi568815586r_56612785.tfa (gi568815586r:56612785_56824521), 211737 bp

>pF1KB8216 645
>gi568815586r:56612785_56824521 (Chr12)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-156  (109835-109920)   100% ->
157-234  (110083-110160)   98% ->
235-381  (110839-110985)   100% ->
382-510  (111332-111460)   100% ->
511-634  (111614-111737)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGGCGAAGCCACAGAAACCGTCCCTGCTACAGAGCAGGAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGGCGAAGCCACAGAAACCGTCCCTGCTACAGAGCAGGAGTTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCCCCAGGCTGAGACAG         GGTCTGGAACAGAATCTGACA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCCCCAGGCTGAGACAGGTA...TAGGGTCTGGAACAGAATCTGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGATGAATCAGTACCAGAGCTTGAAGAACAGGATTCCACCCAGGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109856 GTGATGAATCAGTACCAGAGCTTGAAGAACAGGATTCCACCCAGGCAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACACAACAAGCCCAG         CTGGCGGCAGCAGCTGAAATCGATGA
        |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| |||||
 109906 ACACAACAAGCCCAGGTG...TAGCTGGCGGCAGCAGCTGAAATTGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAACCAGTCAGTAAAGCAAAACAGAGTCGGAGTGAAAAGAAGGCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110109 AGAACCAGTCAGTAAAGCAAAACAGAGTCGGAGTGAAAAGAAGGCACGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AG         GCTATGTCCAAACTGGGTCTTCGGCAGGTTACAGGAGTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110159 AGGTA...TAGGCTATGTCCAAACTGGGTCTTCGGCAGGTTACAGGAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACTAGAGTCACTATCCGGAAATCTAAGAATATCCTCTTTGTCATCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110878 ACTAGAGTCACTATCCGGAAATCTAAGAATATCCTCTTTGTCATCACAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCAGATGTCTACAAGAGCCCTGCTTCAGATACTTACATAGTTTTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110928 ACCAGATGTCTACAAGAGCCCTGCTTCAGATACTTACATAGTTTTTGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGCCAAG         ATCGAAGATTTATCCCAGCAAGCACAACTAGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110978 AAGCCAAGGTG...TAGATCGAAGATTTATCCCAGCAAGCACAACTAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTGCTGAGAAATTCAAAGTTCAAGGTGAAGCTGTCTCAAACATTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111365 GCTGCTGAGAAATTCAAAGTTCAAGGTGAAGCTGTCTCAAACATTCAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAACACACAGACTCCAACTGTACAAGAGGAGAGTGAAGAGGAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111415 AAACACACAGACTCCAACTGTACAAGAGGAGAGTGAAGAGGAAGAGGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      GTCGATGAAACAGGTGTAGAAGTTAAGGACATAGAATTGGTCATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 111465 ..CAGGTCGATGAAACAGGTGTAGAAGTTAAGGACATTGAATTGGTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCACAAGCAAATGTGTCGAGAGCAAAGGCAGTCCGAGCCCTGAAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111659 TCACAAGCAAATGTGTCGAGAGCAAAGGCAGTCCGAGCCCTGAAGAACAA

    650     .    :    .    :    .
    606 CAGTAATGATATTGTAAATGCGATTATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 111709 CAGTAATGATATTGTAAATGCGATTATGG