seq1 = pF1KB8215.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KB8215/gi568815575r_70187276.tfa (gi568815575r:70187276_70389341), 202066 bp

>pF1KB8215 420
>gi568815575r:70187276_70389341 (ChrX)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-171  (100829-100912)   100% ->
172-228  (101169-101225)   100% ->
229-327  (101512-101610)   100% ->
328-388  (102006-102066)   100% ->
389-420  (102226-102257)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGCCGGATTCCTTATGATGACTACCCGGTGGTTTTCTTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAGCCGGATTCCTTATGATGACTACCCGGTGGTTTTCTTGCCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTATGAGAATCCTCCAGCATGGATTCCTCCTCATGAG         AGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 CTATGAGAATCCTCCAGCATGGATTCCTCCTCATGAGGTG...CAGAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TACACCACCCGGACTACAACAATGAGTTGACCCAGTTTCTGCCCCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100833 TACACCACCCGGACTACAACAATGAGTTGACCCAGTTTCTGCCCCGAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCACACTGAAGAAGCCTCCTGGAGCTCAG         TTGGGATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100883 ATCACACTGAAGAAGCCTCCTGGAGCTCAGGTG...CAGTTGGGATTTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATCCGAGGAGGAAAGGCCTCCCAGCTAGGCATCTTCATCTCCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101180 CATCCGAGGAGGAAAGGCCTCCCAGCTAGGCATCTTCATCTCCAAGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    229      GTGATTCCTGACTCTGATGCACATAGAGCAGGACTGCAGGAAGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101230 ..CAGGTGATTCCTGACTCTGATGCACATAGAGCAGGACTGCAGGAAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACCAAGTTCTAGCTGTGAATGATGTGGATTTCCAAGATATTGAGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101557 GACCAAGTTCTAGCTGTGAATGATGTGGATTTCCAAGATATTGAGCACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAG         GCTGTTGAGATCCTGAAGACAGCTCGTGAAATCAGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101607 CAAGGTG...CAGGCTGTTGAGATCCTGAAGACAGCTCGTGAAATCAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCGTGTGCGCTTCTTTCCCTACA         ATTATCATCGCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102043 TGCGTGTGCGCTTCTTTCCCTACAGTA...CAGATTATCATCGCCAAAAA

    450     .    :    .
    406 GAGAGGACTGTGCAC
        |||||||||||||||
 102243 GAGAGGACTGTGCAC