seq1 = pF1KB8201.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB8201/gi568815597r_153882102.tfa (gi568815597r:153882102_154086236), 204135 bp

>pF1KB8201 609
>gi568815597r:153882102_154086236 (Chr1)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-185  (101456-101516)   100% ->
186-246  (102656-102716)   100% ->
247-324  (102941-103018)   100% ->
325-414  (103429-103518)   100% ->
415-480  (103637-103702)   100% ->
481-534  (103793-103846)   100% ->
535-609  (104061-104135)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAAGCCTACGACCACCTCTTCAAGTTGCTGCTGATCGGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAAGCCTACGACCACCTCTTCAAGTTGCTGCTGATCGGGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGGTGGGCAAGACTTGTCTGATCATTCGCTTTGCAGAGGACAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGGTGGGCAAGACTTGTCTGATCATTCGCTTTGCAGAGGACAACTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACACTTACATCTCCACCATCG         GAATTGATTTCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 ACAACACTTACATCTCCACCATCGGTG...TAGGAATTGATTTCAAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCACTGTGGATATAGAGGGGAAGAAGATCAAACTACAAGTCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101473 CGCACTGTGGATATAGAGGGGAAGAAGATCAAACTACAAGTCTGGTA...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    GGACACGGCTGGCCAAGAGCGGTTCAAGACAATAACTACTGCCTACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102653 TAGGGACACGGCTGGCCAAGAGCGGTTCAAGACAATAACTACTGCCTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCGTGGAGCCATG         GGCATTATCCTAGTATACGACATCACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102703 ACCGTGGAGCCATGGTA...CAGGGCATTATCCTAGTATACGACATCACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATGAGAAATCTTTCGAGAATATTCAGAACTGGATGAAAAGCATCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102968 GATGAGAAATCTTTCGAGAATATTCAGAACTGGATGAAAAGCATCAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         AATGCCTCGGCTGGGGTGGAGCGCCTCTTGCTGGGGAACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103018 GGTG...CAGAATGCCTCGGCTGGGGTGGAGCGCCTCTTGCTGGGGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AATGTGACATGGAGGCCAAGAGGAAGGTGCAGAAGGAGCAGGCCGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103469 AATGTGACATGGAGGCCAAGAGGAAGGTGCAGAAGGAGCAGGCCGATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415          TTGGCTCGAGAGCATGGAATCCGATTTTTCGAAACTAGTGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103519 GTG...TAGTTGGCTCGAGAGCATGGAATCCGATTTTTCGAAACTAGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAAATCCAGTATGAATGTGGATGAG         GCTTTTAGTTCCCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103678 TAAATCCAGTATGAATGTGGATGAGGTG...TAGGCTTTTAGTTCCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CCCGGGACATCTTGCTCAAGTCAGGAGGCCGGAGATCA         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103809 CCCGGGACATCTTGCTCAAGTCAGGAGGCCGGAGATCAGTA...TAGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 AACGGCAACAAGCCTCCCAGTACTGACCTGAAAACTTGTGACAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104064 AACGGCAACAAGCCTCCCAGTACTGACCTGAAAACTTGTGACAAGAAGAA

    650     .    :    .    :
    588 CACCAACAAGTGCTCCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||
 104114 CACCAACAAGTGCTCCCTGGGC