seq1 = pF1KB8195.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB8195/gi568815579r_2657346.tfa (gi568815579r:2657346_2869068), 211723 bp

>pF1KB8195 939
>gi568815579r:2657346_2869068 (Chr19)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-207  (101383-101489)   100% ->
208-292  (101849-101933)   100% ->
293-392  (103784-103883)   100% ->
393-497  (105312-105416)   100% ->
498-636  (106425-106563)   100% ->
637-699  (107547-107609)   100% ->
700-737  (109775-109812)   100% ->
738-827  (111287-111376)   100% ->
828-939  (111612-111723)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAACAAGAAGCGCCTGGCCTACGCCATCATCCAGTTCCTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAACAAGAAGCGCCTGGCCTACGCCATCATCCAGTTCCTGCATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCTCCGGCACGGGGGCCTCTCGTCCGATGCTCAGGAGAGCTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCTCCGGCACGGGGGCCTCTCGTCCGATGCTCAGGAGAGCTTGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          TCGCCATCCAGTGCCTGGAGACTGCGTTTGGGGTGACGGTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...CAGTCGCCATCCAGTGCCTGGAGACTGCGTTTGGGGTGACGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGACAGTGACCTTGCGCTCCCTCAGACTCTGCCGGAGATATTTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101424 GAAGACAGTGACCTTGCGCTCCCTCAGACTCTGCCGGAGATATTTGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTGCCACGGGCAAG         GAGATGCCGCAGGACCTGAGGAGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101474 GGCTGCCACGGGCAAGGTG...CAGGAGATGCCGCAGGACCTGAGGAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGCGCGAACCCCGCCTTCCGAGGAGGACTCAGCAGAGGCAGAGCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101874 CCGCGCGAACCCCGCCTTCCGAGGAGGACTCAGCAGAGGCAGAGCGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAACCGAAG         GAAACGAGCAGATGAAAGTGGAAAACTTTGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101924 AAAACCGAAGGTA...TAGGAAACGAGCAGATGAAAGTGGAAAACTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCTGCCGTGCATTTCTACGGAAAAGCCATCGAGCTCAACCCAGCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103815 AGCTGCCGTGCATTTCTACGGAAAAGCCATCGAGCTCAACCCAGCCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCGTCTATTTCTGCAACAG         AGCCGCAGCCTACAGCAAACTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103865 CCGTCTATTTCTGCAACAGGTA...CAGAGCCGCAGCCTACAGCAAACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCAACTACGCAGGCGCGGTGCAGGACTGTGAGCGGGCCATCTGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105334 GGCAACTACGCAGGCGCGGTGCAGGACTGTGAGCGGGCCATCTGCATTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCGGCCTACAGCAAGGCCTACGGCAGGATGGG         CCTGGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105384 CCCGGCCTACAGCAAGGCCTACGGCAGGATGGGGTG...CAGCCTGGCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTCCAGCCTCAACAAGCACGTGGAGGCCGTGGCTTACTACAAGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106433 TCTCCAGCCTCAACAAGCACGTGGAGGCCGTGGCTTACTACAAGAAGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGGAGCTGGACCCCGACAACGAGACATACAAGTCCAACCTCAAGATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106483 CTGGAGCTGGACCCCGACAACGAGACATACAAGTCCAACCTCAAGATAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGAGCTGAAGCTGCGGGAGGCCCCCAGCCCC         ACGGGAGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106533 GGAGCTGAAGCTGCGGGAGGCCCCCAGCCCCGTG...CAGACGGGAGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGGCAGCTTCGACATCGCCGGCCTGCTGAACAACCCTGGCTTCATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107557 TGGGCAGCTTCGACATCGCCGGCCTGCTGAACAACCCTGGCTTCATGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATG         GCTTCGAACCTAATGAACAATCCCCAGATTCAGCAGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107607 ATGGTA...CAGGCTTCGAACCTAATGAACAATCCCCAGATTCAGCAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738          CATGTCCGGCATGATTTCGGGTGGCAACAACCCCTTGGGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109813 GTA...CAGCATGTCCGGCATGATTTCGGGTGGCAACAACCCCTTGGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTCCCGGCACCAGCCCCTCGCAGAACGACCTGGCCAGCCTCATCCAGGC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111328 CTCCCGGCACCAGCCCCTCGCAGAACGACCTGGCCAGCCTCATCCAGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828         GGGCCAGCAGTTTGCCCAGCAGATGCAGCAGCAGAACCCAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111378 TG...CAGGGGCCAGCAGTTTGCCCAGCAGATGCAGCAGCAGAACCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GTTGATAGAGCAGCTCAGGAGCCAGATCCGGAGTCGGACGCCCAGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111654 GTTGATAGAGCAGCTCAGGAGCCAGATCCGGAGTCGGACGCCCAGCGCCA

   1000     .    :    .    :
    920 GCAACGACGACCAGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||
 111704 GCAACGACGACCAGCAGGAG