seq1 = pF1KB8194.tfa, 1641 bp
seq2 = pF1KB8194/gi568815590f_27997217.tfa (gi568815590f:27997217_28289722), 292506 bp

>pF1KB8194 1641
>gi568815590f:27997217_28289722 (Chr8)

1-19  (95999-96017)   100% ->
20-119  (100003-100102)   100% ->
120-258  (102612-102750)   100% ->
259-329  (109497-109567)   100% ->
330-393  (110697-110760)   100% ->
394-462  (113154-113222)   100% ->
463-617  (115803-115957)   100% ->
618-779  (132286-132447)   100% ->
780-906  (135062-135188)   100% ->
907-1100  (140482-140675)   100% ->
1101-1191  (158726-158816)   100% ->
1192-1257  (161352-161417)   100% ->
1258-1485  (163013-163240)   100% ->
1486-1567  (164781-164862)   100% ->
1568-1641  (192433-192506)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCAGAAGCGGAAAG         GAGATCTCAGCCCTGCTGAGCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  95999 ATGAGGCAGAAGCGGAAAGGTG...CAGGAGATCTCAGCCCTGCTGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GATGATGCTGACTATAGGAGATGTTATTAAACAACTGATTGAAGCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 GATGATGCTGACTATAGGAGATGTTATTAAACAACTGATTGAAGCCCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCAGGGGAAAGACATCGATCTAAATAA         GGTGAAAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100075 AGCAGGGGAAAGACATCGATCTAAATAAGTA...CAGGGTGAAAACCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAGCTGCCAAATATGGCCTTTCTGCCCAGCCCCGCCTGGTGGATATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102625 ACAGCTGCCAAATATGGCCTTTCTGCCCAGCCCCGCCTGGTGGATATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTGCCGTCCCTCCTCAGTATCGCAAGGTCTTGATGCCCAAGTTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102675 TGCTGCCGTCCCTCCTCAGTATCGCAAGGTCTTGATGCCCAAGTTAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGAAACCCATCAGAACTGCTAGTGGG         ATTGCTGTCGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102725 CGAAACCCATCAGAACTGCTAGTGGGGTG...TAGATTGCTGTCGTGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGATGTGCAAACCCCACAGATGTCCACACATCAGTTTTACAGGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109512 GTGATGTGCAAACCCCACAGATGTCCACACATCAGTTTTACAGGAAATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATGTGT         ATACTGCCCTGGTGGACCTGATTCTGATTTTGAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109562 ATGTGTGTA...CAGATACTGCCCTGGTGGACCTGATTCTGATTTTGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATTCCACCCAGTCTTACACTGGCTATGAG         CCAACCTCCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110732 ATTCCACCCAGTCTTACACTGGCTATGAGGTA...TAGCCAACCTCCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGAGCTATCCGTGCCAGATATGACCCTTTCCTACAGACAAGACACCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113166 AGAGCTATCCGTGCCAGATATGACCCTTTCCTACAGACAAGACACCGAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGAACAG         TTAAAACAACTTGGTCATAGTGTGGATAAAGTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113216 AGAACAGGTA...CAGTTAAAACAACTTGGTCATAGTGTGGATAAAGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGTTTATTGTGATGGGTGGAACGTTTATGGCCCTTCCAGAAGAATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115837 AGTTTATTGTGATGGGTGGAACGTTTATGGCCCTTCCAGAAGAATACAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GATTATTTTATTCGAAATTTACATGATGCCTTATCAGGACATACTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115887 GATTATTTTATTCGAAATTTACATGATGCCTTATCAGGACATACTTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CAATATTTACGAGGCAGTCAA         GTATTCTGAGAGAAGCCTCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 115937 CAATATTTACGAGGCAGTCAAGTA...CAGGTATTCTGAGAGAAGCCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CAAAGTGTATTGGAATTACTATTGAAACCAGACCAGATTACTGCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132306 CAAAGTGTATTGGAATTACTATTGAAACCAGACCAGATTACTGCATGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CGACATTTAAGTGACATGTTGACCTATGGCTGCACAAGGCTGGAGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132356 CGACATTTAAGTGACATGTTGACCTATGGCTGCACAAGGCTGGAGATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGTGCAGAGTGTTTATGAAGATGTGGCTAGAGACACCAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 132406 GGTGCAGAGTGTTTATGAAGATGTGGCTAGAGACACCAACAGGTA...TA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    780  GGGCCACACTGTGAAGGCAGTGTGTGAGTCATTTCACCTGGCCAAAGAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135061 GGGGCCACACTGTGAAGGCAGTGTGTGAGTCATTTCACCTGGCCAAAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCCGGTTTTAAAGTGGTGGCCCATATGATGCCTGACCTGCCAAACGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135111 TCCGGTTTTAAAGTGGTGGCCCATATGATGCCTGACCTGCCAAACGTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ACTAGAAAGAGACATTGAACAGTTCACA         GAGTTTTTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 135161 ACTAGAAAGAGACATTGAACAGTTCACAGTA...CAGGAGTTTTTTGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACCCTGCTTTTCGTCCCGATGGGCTGAAACTCTATCCTACCCTGGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140495 ACCCTGCTTTTCGTCCCGATGGGCTGAAACTCTATCCTACCCTGGTGATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CGTGGGACCGGGCTTTATGAGCTTTGGAAATCAGGAAGATATAAGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140545 CGTGGGACCGGGCTTTATGAGCTTTGGAAATCAGGAAGATATAAGAGTTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CTCTCCTAGTGACCTGGTTGAATTGGTGGCTCGGATCCTAGCCCTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140595 CTCTCCTAGTGACCTGGTTGAATTGGTGGCTCGGATCCTAGCCCTCGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTCCATGGACTCGAGTGTACCGAGTACAGAG         GGATATTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140645 CTCCATGGACTCGAGTGTACCGAGTACAGAGGTA...CAGGGATATTCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATGCCTTTAGTTAGCTCAGGAGTAGAGCATGGTAACCTGAGAGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158736 ATGCCTTTAGTTAGCTCAGGAGTAGAGCATGGTAACCTGAGAGAGCTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACTTGCAAGAATGAAAGACCTCGGAATACAG         TGTCGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 158786 ACTTGCAAGAATGAAAGACCTCGGAATACAGGTA...CAGTGTCGAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGAGAACCAGAGAAGTTGGAATCCAAGAAATTCATCACAAAGTACGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161362 TGAGAACCAGAGAAGTTGGAATCCAAGAAATTCATCACAAAGTACGGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TACCAG         GTTGAATTGGTAAGGAGAGATTATGTTGCAAATGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161412 TACCAGGTT...TAGGTTGAATTGGTAAGGAGAGATTATGTTGCAAATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TGGCTGGGAAACATTCTTGTCATACGAAGACCCAGATCAAGACATTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163048 TGGCTGGGAAACATTCTTGTCATACGAAGACCCAGATCAAGACATTTTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TTGGCCTCCTACGATTACGCAAGTGTTCAGAAGAAACTTTCCGTTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163098 TTGGCCTCCTACGATTACGCAAGTGTTCAGAAGAAACTTTCCGTTTCGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TTGGGTGGAGGTGTCTCCATAGTACGAGAGCTGCATGTGTATGGGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163148 TTGGGTGGAGGTGTCTCCATAGTACGAGAGCTGCATGTGTATGGGAGTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGTCCCTGTGAGCAGCCGGGATCCTACTAAATTTCAGCATCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 163198 GGTCCCTGTGAGCAGCCGGGATCCTACTAAATTTCAGCATCAGGTA...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1486   GGATTTGGCATGCTGCTGATGGAGGAAGCAGAAAGAATAGCTAGAGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164779 AGGGATTTGGCATGCTGCTGATGGAGGAAGCAGAAAGAATAGCTAGAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GAACATGGGTCTGGGAAAATCGCTGTGATATCAG         GGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 164829 GAACATGGGTCTGGGAAAATCGCTGTGATATCAGGTA...CAGGGGTCGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CACCAGGAATTATTATAGAAAGATCGGCTACAGATTACAAGGCCCGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192440 CACCAGGAATTATTATAGAAAGATCGGCTACAGATTACAAGGCCCGTACA

   1750     .    :    .
   1625 TGGTGAAGATGCTGAAA
        |||||||||||||||||
 192490 TGGTGAAGATGCTGAAA