seq1 = pF1KB8193.tfa, 357 bp
seq2 = pF1KB8193/gi568815597r_23458963.tfa (gi568815597r:23458963_23659426), 200464 bp

>pF1KB8193 357
>gi568815597r:23458963_23659426 (Chr1)

(complement)

1-300  (100001-100300)   100% ->
301-357  (100408-100464)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGCGCTGAGCCCGGTGCGCGGCTGCTACGAGGCGGTGTGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGCGCTGAGCCCGGTGCGCGGCTGCTACGAGGCGGTGTGCTGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGGAACGCAGTCTGGCCATCGCCCGGGGCCGAGGGAAGGGCCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGGAACGCAGTCTGGCCATCGCCCGGGGCCGAGGGAAGGGCCCGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAGGAGCCGCTGAGCTTGCTGGACGACATGAACCACTGCTACTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAGGAGCCGCTGAGCTTGCTGGACGACATGAACCACTGCTACTCCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCGGGAACTGGTACCCGGAGTCCCGAGAGGCACTCAGCTTAGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCGGGAACTGGTACCCGGAGTCCCGAGAGGCACTCAGCTTAGCCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAATCCTACAGCGCGTCATCGACTACATTCTCGACCTGCAGGTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAATCCTACAGCGCGTCATCGACTACATTCTCGACCTGCAGGTAGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCGAGCCAGCCCCTGGACCCCCTGATGGCCCCCACCTTCCCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCGAGCCAGCCCCTGGACCCCCTGATGGCCCCCACCTTCCCATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301          ACAGCCGAGCTCGCTCCGGAACTTGTCATCTCCAACGACAA
        >>>...>>>|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTA...CAGACAGCCGAGCTCACTCCGGAACTTGTCATCTCCAACGACAA

    350     .    :    .
    342 AAGGAGCTTTTGCCAC
        ||||||||||||||||
 100449 AAGGAGCTTTTGCCAC