seq1 = pF1KB8189.tfa, 1338 bp
seq2 = pF1KB8189/gi568815591r_99971146.tfa (gi568815591r:99971146_100177357), 206212 bp

>pF1KB8189 1338
>gi568815591r:99971146_100177357 (Chr7)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-144  (101728-101816)   100% ->
145-271  (102097-102223)   100% ->
272-1338  (105146-106212)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACTCAGGCTGATCTCGTATCTCAGGAACCTCAGGCCCTGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACTCAGGCTGATCTCGTATCTCAGGAACCTCAGGCCCTGCTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTG         CTCTTCCTTCAAAAGTTCCTGCCTTTTCCGACAAGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTGGTG...CAGCTCTTCCTTCAAAAGTTCCTGCCTTTTCCGACAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAGCCTGGGGGATGAGATGTTGGCGGCTGCGCTCCTAAAGGCCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101764 ACAGCCTGGGGGATGAGATGTTGGCGGCTGCGCTCCTAAAGGCCAAGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAG         GAGCTGGTAACCTTTGAGGATGTAGCTGTGTACTTCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101814 CAGGTG...CAGGAGCTGGTAACCTTTGAGGATGTAGCTGTGTACTTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGGAAGGAGTGGAAGCGTTTGGAACCTGCTCAGAGGGACCTCTATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102135 CCGGAAGGAGTGGAAGCGTTTGGAACCTGCTCAGAGGGACCTCTATAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTGATGCTGGAGAATTACGGGAATGTGTTCTCACTGG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102185 ATGTGATGCTGGAGAATTACGGGAATGTGTTCTCACTGGGTA...CAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGTGAGACCAGGACTGAAAATGATCAAGAAATTTCTGAAGACACAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105148 CGTGAGACCAGGACTGAAAATGATCAAGAAATTTCTGAAGACACAAGATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACATGGGGTCCTACTGGGAAGATTTCAAAAGGATATTTCTCAGGGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105198 ACATGGGGTCCTACTGGGAAGATTTCAAAAGGATATTTCTCAGGGTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTTTAAAGAAGCCTATGAACGAGAAGTCAGTCTGAAAAGGCCGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105248 AGTTTAAAGAAGCCTATGAACGAGAAGTCAGTCTGAAAAGGCCGCTGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACTCCCCTGGAGAAAGACTGAACAGGAAAATGCCAGATTTTGGTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105298 AACTCCCCTGGAGAAAGACTGAACAGGAAAATGCCAGATTTTGGTCAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACAGTTGAGGAGAAGCTAACCCCCAGGGGAGAGAGAAGCGAGAAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105348 GACAGTTGAGGAGAAGCTAACCCCCAGGGGAGAGAGAAGCGAGAAATATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGATTTTGGGAACAGCTTCACTGTGAATTCCAACCTTATCTCACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105398 ATGATTTTGGGAACAGCTTCACTGTGAATTCCAACCTTATCTCACATCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGACTCCCCGTGGGAGACAGACCCCATAAGTGTGATGAATGTAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105448 AGACTCCCCGTGGGAGACAGACCCCATAAGTGTGATGAATGTAGCAAGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTTAATCGAACTTCAGACCTTATTCAACATCAGAGAATCCACACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105498 CTTTAATCGAACTTCAGACCTTATTCAACATCAGAGAATCCACACTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAAAGCCCTATGAATGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105548 AAAAGCCCTATGAATGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CACCTTATTCAGCATCAGAGAATCCACACTGGGGAAAAACCTTATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105598 CACCTTATTCAGCATCAGAGAATCCACACTGGGGAAAAACCTTATGAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TAGTGATTGTGGGAAAACCTTCAGCTGTAGCTCTGCCCTCATTCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105648 TAGTGATTGTGGGAAAACCTTCAGCTGTAGCTCTGCCCTCATTCTGCATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGAGGATCCACACGGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGAGTGTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105698 GGAGGATCCACACGGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGAGTGTGGGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACCTTCAGCTGGAGCTCCACCCTCACCCACCATCAGAGAATCCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105748 ACCTTCAGCTGGAGCTCCACCCTCACCCACCATCAGAGAATCCACACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGAGAAACCCTACGCCTGCAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105798 TGAGAAACCCTACGCCTGCAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCAGGAGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CAACCCTTATTCACCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAAACCCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105848 CAACCCTTATTCACCATCAGAGAATCCACACTGGAGAAAAACCCTATGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGCTCACACCTCTATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105898 TGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGCTCACACCTCTATCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAGCCCTACGAATGTATGGAATGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105948 CCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAGCCCTACGAATGTATGGAATGTGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GAAAGTTTACCTACAGTTCAGGCCTTATTCAGCATCAAAGAATCCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105998 GAAAGTTTACCTACAGTTCAGGCCTTATTCAGCATCAAAGAATCCACACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GGGGAGAACCCCTATGAATGTAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106048 GGGGAGAACCCCTATGAATGTAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGGTACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTCGGCTCTTGTTCGCCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106098 CTCGGCTCTTGTTCGCCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCTTTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ATGGGATCGGCATGAGCAAAAGCTCCCTCAGAGTTACGACCGAGTTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106148 ATGGGATCGGCATGAGCAAAAGCTCCCTCAGAGTTACGACCGAGTTAAAT

   1350     .    :    .
   1324 ATCAGAGAGTCCACG
        |||||||||||||||
 106198 ATCAGAGAGTCCACG