seq1 = pF1KB8178.tfa, 1305 bp
seq2 = pF1KB8178/gi568815584r_64386926.tfa (gi568815584r:64386926_64590533), 203608 bp

>pF1KB8178 1305
>gi568815584r:64386926_64590533 (Chr14)

(complement)

1-173  (100001-100173)   100% ->
174-1305  (102477-103608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACTGCCAGCCATAGCCTTGTTCTTCTCCAGCAGCTGAACATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACTGCCAGCCATAGCCTTGTTCTTCTCCAGCAGCTGAACATGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGAGAATTTGGTTTTCTGTGTGATTGCACAGTTGCAATTGGAGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGAGAATTTGGTTTTCTGTGTGATTGCACAGTTGCAATTGGAGATGTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTCAAAGCCCACAGAGCAGTGCTTGCTGCTTTTTCTAACTATTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTCAAAGCCCACAGAGCAGTGCTTGCTGCTTTTTCTAACTATTTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGATATTTATTCACCAAACAAG         TGAATGCATAAAAATACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100151 ATGATATTTATTCACCAAACAAGGTA...CAGTGAATGCATAAAAATACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCAACTGACATCCAACCTGACATATTCAGCTATTTGTTGCACATTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 ACCAACTGACATCCAACCTGACATATTCAGCTATTTGTTGCACATTATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACACGGGGAAAGGGCCAAAACAGATTGTGGATCATAGTCGTTTGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102545 ACACGGGGAAAGGGCCAAAACAGATTGTGGATCATAGTCGTTTGGAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGATTCGATTTCTTCACGCCGACTACCTTTCTCACATTGCAACTGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102595 GGGATTCGATTTCTTCACGCCGACTACCTTTCTCACATTGCAACTGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAATCAAGTGTTCTCACCAGAGACTGTGCAGTCCTCAAATTTATATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 GAATCAAGTGTTCTCACCAGAGACTGTGCAGTCCTCAAATTTATATGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTCAGATCTCAACAACCCAAAAAACAGTTGTCAAACAAGGACTGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 TTCAGATCTCAACAACCCAAAAAACAGTTGTCAAACAAGGACTGGAGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAGAAGCTCCTTCCAGTAACAGTGGAAACAGAGCTGCTGTCCAGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 AAAGAAGCTCCTTCCAGTAACAGTGGAAACAGAGCTGCTGTCCAGGGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCACCCCCAGTTGCAGTTGTCTCTTGCTATTGGTCTGGATGATGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102795 CCACCCCCAGTTGCAGTTGTCTCTTGCTATTGGTCTGGATGATGGCACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGACCAGCAGAGGGCCTGTCCTGCCACCCAGGCCCTGGAGGAGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102845 CAGACCAGCAGAGGGCCTGTCCTGCCACCCAGGCCCTGGAGGAGCACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGCCCCCAGTTTCCATCAAGCAGGAGAGATGTGACCCAGAATCTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102895 AAGCCCCCAGTTTCCATCAAGCAGGAGAGATGTGACCCAGAATCTGTGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCCAGAGCCACCCCTCACCCTCATCAGAGGTGACAGGCCCCACTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102945 CTCCCAGAGCCACCCCTCACCCTCATCAGAGGTGACAGGCCCCACTTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTGAAAACAGTGTCAAAATACACTTATGCCATTACTGTGGGGAACGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102995 CTGAAAACAGTGTCAAAATACACTTATGCCATTACTGTGGGGAACGTTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GATTCCCGTAGTAACCTAAGGCAACATCTCCATACACATGTGTCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103045 GATTCCCGTAGTAACCTAAGGCAACATCTCCATACACATGTGTCTGGATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCTGCCATTCGGTGTCCCTGCTTCCATTCTGGAAAGTAATGACCTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103095 CCTGCCATTCGGTGTCCCTGCTTCCATTCTGGAAAGTAATGACCTTGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AAGTGCATCCCCTTAATGAAAACAGCGAGGCCCTTGAATGCCGCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103145 AAGTGCATCCCCTTAATGAAAACAGCGAGGCCCTTGAATGCCGCAGGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGCTCCTTCATTGTTAAGGAGAATGAACAGCAGCCAGACCACACCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103195 AGCTCCTTCATTGTTAAGGAGAATGAACAGCAGCCAGACCACACCAACCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGGTACCACAGAGCCTTTGCAGATCAGTCAAGTATCTTTGATCTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103245 GGGTACCACAGAGCCTTTGCAGATCAGTCAAGTATCTTTGATCTCCAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACACAGAGCCAGTAGAATTAAACTGTAATTTTTCTTTTTCAAGGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103295 ACACAGAGCCAGTAGAATTAAACTGTAATTTTTCTTTTTCAAGGAAAAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AAAATGAGCTGTACCATCTGTGGTCATAAATTCCCTCGAAAGAGCCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103345 AAAATGAGCTGTACCATCTGTGGTCATAAATTCCCTCGAAAGAGCCAATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GTTGGAACACATGTATACACACAAAGGTAAATCTTACAGATATAACCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103395 GTTGGAACACATGTATACACACAAAGGTAAATCTTACAGATATAACCGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCCAAAGGTTTGGTAATGCATTGGCCCAGAGATTTCAGCCATACTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103445 GCCAAAGGTTTGGTAATGCATTGGCCCAGAGATTTCAGCCATACTGTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AGCTGGTCTGATGTCTCCCTGAAAAGTTCTCGCTTGTCACAAGAACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103495 AGCTGGTCTGATGTCTCCCTGAAAAGTTCTCGCTTGTCACAAGAACACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGACTTGCCTTGTGCCTTAGAGTCAGAGCTCACACAAGAAAATGTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103545 AGACTTGCCTTGTGCCTTAGAGTCAGAGCTCACACAAGAAAATGTGGATA

   1300     .    :
   1292 CTATCCTAGTTGAG
        ||||||||||||||
 103595 CTATCCTAGTTGAG