seq1 = pF1KB8176.tfa, 735 bp
seq2 = pF1KB8176/gi568815596r_9485289.tfa (gi568815596r:9485289_9730452), 245164 bp

>pF1KB8176 735
>gi568815596r:9485289_9730452 (Chr2)

(complement)

1-294  (100001-100294)   100% ->
295-418  (138938-139061)   100% ->
419-582  (142125-142288)   100% ->
583-678  (142944-143039)   100% ->
679-735  (145108-145164)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGACTGAGCTGATCCAGAAGGCCAAGCTGGCCGAGCAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGACTGAGCTGATCCAGAAGGCCAAGCTGGCCGAGCAGGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCTACGACGACATGGCCACCTGCATGAAGGCAGTGACCGAGCAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCTACGACGACATGGCCACCTGCATGAAGGCAGTGACCGAGCAGGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGCTGTCCAACGAGGAGCGCAACCTGCTCTCCGTGGCCTACAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGCTGTCCAACGAGGAGCGCAACCTGCTCTCCGTGGCCTACAAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGTCGGGGGCCGCAGGTCCGCCTGGAGGGTCATCTCTAGCATCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGTCGGGGGCCGCAGGTCCGCCTGGAGGGTCATCTCTAGCATCGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGACCGACACCTCCGACAAGAAGTTGCAGCTGATTAAGGACTATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGACCGACACCTCCGACAAGAAGTTGCAGCTGATTAAGGACTATCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAAGTGGAGTCCGAGCTGAGATCCATCTGCACCACGGTGCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100251 AGAAAGTGGAGTCCGAGCTGAGATCCATCTGCACCACGGTGCTGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295    GAATTGTTGGATAAATATTTAATAGCCAATGCAACTAATCCAGAGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138935 CAGGAATTGTTGGATAAATATTTAATAGCCAATGCAACTAATCCAGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TAAGGTCTTCTATCTGAAAATGAAGGGTGATTACTTCCGGTACCTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138985 TAAGGTCTTCTATCTGAAAATGAAGGGTGATTACTTCCGGTACCTTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGTTGCGTGTGGTGATGATCGAAAAC         AAACGATAGATAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 139035 AAGTTGCGTGTGGTGATGATCGAAAACGTA...CAGAAACGATAGATAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCCAAGGAGCTTACCAAGAGGCATTTGATATAAGCAAGAAAGAGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142139 TCCCAAGGAGCTTACCAAGAGGCATTTGATATAAGCAAGAAAGAGATGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACCCACACACCCAATCCGCCTGGGGCTTGCTCTTAACTTTTCTGTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142189 ACCCACACACCCAATCCGCCTGGGGCTTGCTCTTAACTTTTCTGTATTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTATGAGATTCTTAATAACCCAGAGCTTGCCTGCACGCTGGCTAAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142239 ACTATGAGATTCTTAATAACCCAGAGCTTGCCTGCACGCTGGCTAAAACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583          GCTTTTGATGAGGCCATTGCTGAACTTGATACACTGAATGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142289 GTA...CAGGCTTTTGATGAGGCCATTGCTGAACTTGATACACTGAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGACTCATACAAAGACAGCACCCTCATCATGCAGTTGCTTAGAGACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142985 AGACTCATACAAAGACAGCACCCTCATCATGCAGTTGCTTAGAGACAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TAACA         CTTTGGACATCAGACAGTGCAGGAGAAGAATGTGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143035 TAACAGTG...TAGCTTTGGACATCAGACAGTGCAGGAGAAGAATGTGAT

    750     .    :    .    :
    715 GCGGCAGAAGGGGCTGAAAAC
        |||||||||||||||||||||
 145144 GCGGCAGAAGGGGCTGAAAAC