seq1 = pF1KB8175.tfa, 1503 bp
seq2 = pF1KB8175/gi568815597r_37858189.tfa (gi568815597r:37858189_38089965), 231777 bp

>pF1KB8175 1503
>gi568815597r:37858189_38089965 (Chr1)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-144  (100371-100418)   100% ->
145-197  (102130-102182)   100% ->
198-303  (102288-102393)   100% ->
304-376  (105187-105259)   100% ->
377-468  (105706-105797)   100% ->
469-551  (108155-108237)   100% ->
552-690  (109242-109380)   100% ->
691-759  (110433-110501)   100% ->
760-827  (110911-110978)   100% ->
828-935  (111139-111246)   100% ->
936-1005  (113013-113082)   100% ->
1006-1170  (120231-120395)   100% ->
1171-1281  (120502-120612)   100% ->
1282-1372  (121832-121922)   100% ->
1373-1428  (129791-129846)   100% ->
1429-1503  (131703-131777)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACAATACTGGAGCAGCAGCGGCGCTATCATGAGGAGAAGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACAATACTGGAGCAGCAGCGGCGCTATCATGAGGAGAAGGAACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCATGGACGTCATGGCTAAAGAGATGCTCACCAAGAAGTCCACG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GCTCATGGACGTCATGGCTAAAGAGATGCTCACCAAGAAGTCCACGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      CTCCGGGACCAGATCAATTCTGATCACCGCACTCGGGCCATGCAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGCTCCGGGACCAGATCAATTCTGATCACCGCACTCGGGCCATGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAT         AGGTATATGGAGGTCAGTGGGAACCTGAGGGATTTGTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100416 GATGTG...CAGAGGTATATGGAGGTCAGTGGGAACCTGAGGGATTTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGATGATAAGGATGG         ATTACGAAAGGAGGAGCTCAATGCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102168 TGATGATAAGGATGGGTA...CAGATTACGAAAGGAGGAGCTCAATGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTTCAGGACCCAATGAGTTTGCTGAATTCTATAATAGACTCAAGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102314 TTTCAGGACCCAATGAGTTTGCTGAATTCTATAATAGACTCAAGCAAATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGGAATTCCACCGGAAGCACCCAAATGAG         ATCTGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102364 AAGGAATTCCACCGGAAGCACCCAAATGAGGTA...CAGATCTGTGTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AATGTCAGTGGAATTTGAGGAACTCCTGAAGGCTCGAGAGAATCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105198 AATGTCAGTGGAATTTGAGGAACTCCTGAAGGCTCGAGAGAATCCAAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGAGGCACAAA         ACTTGGTGGAGTTCACAGATGAAGAGGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105248 AAGAGGCACAAAGTA...CAGACTTGGTGGAGTTCACAGATGAAGAGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATGGTCGTTATCTCGATCTCCATGACTGTTACCTCAAGTACATTAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105735 TATGGTCGTTATCTCGATCTCCATGACTGTTACCTCAAGTACATTAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GAAGGCATCTGAG         AAGCTGGATTATATCACATACCTGTCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105785 GAAGGCATCTGAGGTA...CAGAAGCTGGATTATATCACATACCTGTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCTTTGACCAATTATTTGACATTCCTAAAGAAAGGAAGAATGCAGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108183 TCTTTGACCAATTATTTGACATTCCTAAAGAAAGGAAGAATGCAGAGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAGAG         ATACCTAGAGATGCTGCTTGAGTACCTTCAGGATTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108233 AAGAGGTA...TAGATACCTAGAGATGCTGCTTGAGTACCTTCAGGATTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CACAGATAGAGTGAAGCCTCTCCAAGATCAGAATGAACTTTTTGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109278 CACAGATAGAGTGAAGCCTCTCCAAGATCAGAATGAACTTTTTGGGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTCAGGCTGAGTTTGAGAAGAAATGGGAGAATGGGACCTTTCCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109328 TTCAGGCTGAGTTTGAGAAGAAATGGGAGAATGGGACCTTTCCTGGATGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CCG         AAAGAGACAAGCAGTGCCCTGACCCATGCTGGAGCCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109378 CCGGTG...CAGAAAGAGACAAGCAGTGCCCTGACCCATGCTGGAGCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCTTGACCTCTCTGCATTCTCCTCCTGGGAG         GAGTTGGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110471 TCTTGACCTCTCTGCATTCTCCTCCTGGGAGGTA...TAGGAGTTGGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CTCTGGGTTTGGACAGATTGAAATCTGCTCTCTTAGCTTTAGGCTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110921 CTCTGGGTTTGGACAGATTGAAATCTGCTCTCTTAGCTTTAGGCTTGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TGTGGCGG         GACCCTAGAAGAGCGAGCCCAGAGACTATTCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110971 TGTGGCGGGTA...TAGGACCCTAGAAGAGCGAGCCCAGAGACTATTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TACCAAAGGAAAGTCCCTGGAGTCACTTGATACCTCTTTGTTTGCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111172 TACCAAAGGAAAGTCCCTGGAGTCACTTGATACCTCTTTGTTTGCCAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 ATCCCAAGTCAAAGGGCACCAAGCG         AGACACTGAAAGGAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 111222 ATCCCAAGTCAAAGGGCACCAAGCGGTG...CAGAGACACTGAAAGGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 AAAGACATTGCTTTTCTAGAAGCCCAGATCTATGAATATGTAGAGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113029 AAAGACATTGCTTTTCTAGAAGCCCAGATCTATGAATATGTAGAGATTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CGGG         GAACAGCGACATCTCACTCATGAAAATGTACAGCGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113079 CGGGGTA...TAGGAACAGCGACATCTCACTCATGAAAATGTACAGCGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 AGCAAGCCAGGACAGGAGAAGAGCGAGAAGAAGAGGAAGAAGAGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120268 AGCAAGCCAGGACAGGAGAAGAGCGAGAAGAAGAGGAAGAAGAGCAGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AGTGAGAGTGAGAGTGAAGATGAAGAGAACGAGATCATTTACAACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120318 AGTGAGAGTGAGAGTGAAGATGAAGAGAACGAGATCATTTACAACCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 AAACCTGCCACTTGGCTGGGATGGCAAA         CCTATTCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 120368 AAACCTGCCACTTGGCTGGGATGGCAAAGTA...TAGCCTATTCCCTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 GGCTGTATAAGCTTCATGGCCTAAATATCAACTACAACTGTGAGATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120515 GGCTGTATAAGCTTCATGGCCTAAATATCAACTACAACTGTGAGATTTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GGAAACTACACCTACCGAGGGCCCAAAGCCTTCCAGCGACACTTTGCT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 120565 GGAAACTACACCTACCGAGGGCCCAAAGCCTTCCAGCGACACTTTGCTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282        GAATGGCGTCATGCTCATGGCATGAGGTGTTTGGGCATCCCAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120615 A...CAGGAATGGCGTCATGCTCATGGCATGAGGTGTTTGGGCATCCCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 ACACTGCTCACTTTGCTAATGTGACACAGATTGAAGATGCTGTCTCCT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 121875 ACACTGCTCACTTTGCTAATGTGACACAGATTGAAGATGCTGTCTCCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1373        TGTGGGCCAAACTGAAATTGCAGAAGGCTTCAGAACGATGGCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121925 A...CAGTGTGGGCCAAACTGAAATTGCAGAAGGCTTCAGAACGATGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GCCTGACACTGAG         GAAGAATATGAAGACTCAAGTGGGAATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 129834 GCCTGACACTGAGGTG...CAGGAAGAATATGAAGACTCAAGTGGGAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1457 TTGTGAATAAGAAGACATACGAGGATCTGAAAAGACAAGGACTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131731 TTGTGAATAAGAAGACATACGAGGATCTGAAAAGACAAGGACTGCTC