seq1 = pF1KB8173.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KB8173/gi568815579r_47306480.tfa (gi568815579r:47306480_47517351), 210872 bp

>pF1KB8173 1074
>gi568815579r:47306480_47517351 (Chr19)

(complement)

5-185  (99995-100174)   98% ->
186-345  (100389-100548)   100% ->
346-396  (100650-100700)   100% ->
397-447  (102251-102301)   100% ->
448-546  (102537-102635)   100% ->
547-658  (107805-107916)   100% ->
659-807  (108105-108253)   100% ->
808-884  (109924-110000)   100% ->
885-943  (110215-110273)   100% ->
944-1027  (110381-110464)   100% ->
1028-1074  (110826-110872)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      5 CCCGGAGGTATGATGAGCTGCCGCACTACCCAGGCATCGTGGATGGCCCC
        |||  ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CCCCCAG TATGATGAGCTGCCGCACTACCCAGGCATCGTGGATGGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     55 GCAGCCCTGGCTAGCTTCCCAGAGACAGTGCCCGCAGTACCAGGGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 GCAGCCCTGGCTAGCTTCCCAGAGACAGTGCCCGCAGTACCAGGGCCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    105 TGGCCCGCACCGGCCTCCCCAGCCCCTGCCCCCAGGCTTGGACAGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 TGGCCCGCACCGGCCTCCCCAGCCCCTGCCCCCAGGCTTGGACAGCGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    155 GCCTGAAGAGGGAGAAGGATGAGATCTATGG         ACACCCGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100144 GCCTGAAGAGGGAGAAGGATGAGATCTATGGGTG...CAGACACCCGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196 TTCCCCCTCTTGGCCCTGGTCTTTGAGAAATGTGAACTGGCTACATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 TTCCCCCTCTTGGCCCTGGTCTTTGAGAAATGTGAACTGGCTACATGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246 TCCCCGTGACGGGGCCGGAGCTGGGCTGGGGACACCCCCTGGAGGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 TCCCCGTGACGGGGCCGGAGCTGGGCTGGGGACACCCCCTGGAGGTGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296 TCTGCTCCTCTGATTCCTTCAACGAGGACATCGCTGCCTTTGCCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TCTGCTCCTCTGATTCCTTCAACGAGGACATCGCTGCCTTTGCCAAGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    346          GTTCGCTCTGAGAGGCCCCTCTTCTCCTCCAACCCAGAACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 GTG...CAGGTTCGCTCTGAGAGGCCCCTCTTCTCCTCCAACCCAGAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 GGACAATCTG         ATGATCCAGGCCATCCAGGTGCTGCGGTTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100691 GGACAATCTGGTG...CAGATGATCCAGGCCATCCAGGTGCTGCGGTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428 ACCTGCTGGAGCTGGAGAAG         GGAAAGATGCCCATCGACCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102282 ACCTGCTGGAGCTGGAGAAGGTG...AAGGGAAAGATGCCCATCGACCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469 GTCATCGAGGATCGGGACGGCGGCTGCAGGGAGGACTTCGAGGACTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102558 GTCATCGAGGATCGGGACGGCGGCTGCAGGGAGGACTTCGAGGACTACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    519 AGCCTCCTGCCCCAGCCTCCCAGACCAG         AATAATATGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102608 AGCCTCCTGCCCCAGCCTCCCAGACCAGGTG...TAGAATAATATGTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    560 TTCGAGACCATGAGGATAGTGGGTCTGTACATTTGGGGACCCCAGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107818 TTCGAGACCATGAGGATAGTGGGTCTGTACATTTGGGGACCCCAGGTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    610 TCCAGTGGGGGCCTGGCCTCCCAGAGTGGGGACAACTCCAGTGACCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107868 TCCAGTGGGGGCCTGGCCTCCCAGAGTGGGGACAACTCCAGTGACCAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    659         GAGACGGGCTGGACACCAGCGTGGCCTCTCCCAGTTCTGGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107918 TG...CAGGAGACGGGCTGGACACCAGCGTGGCCTCTCCCAGTTCTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAGAAGATGAGGACTTGGACCAGGAGCGACGGCGAAACAAGAAGAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108147 GAGAAGATGAGGACTTGGACCAGGAGCGACGGCGAAACAAGAAGAGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTCCCCAAGGTGGCCACCAACATCATGCGAGCCTGGTTGTTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108197 ATCTTCCCCAAGGTGGCCACCAACATCATGCGAGCCTGGTTGTTCCAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTCG         CACCCGTACCCCTCGGAGGAGCAGAAGAAACAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108247 CCTCTCGGTG...CAGCACCCGTACCCCTCGGAGGAGCAGAAGAAACAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGCGCAGGACACGGGGCTCACCATCCTGCAAGTCAACAACTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 109958 TGGCGCAGGACACGGGGCTCACCATCCTGCAAGTCAACAACTGGTG...C

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    885   GTTCATTAACGCCCGGAGACGCATCGTGCAACCTATGATCGATCAATC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110213 AGGTTCATTAACGCCCGGAGACGCATCGTGCAACCTATGATCGATCAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAACCGCACAG         GGCAGGGTGCAGCCTTCAGCCCAGAGGGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110263 CAACCGCACAGGTA...CAGGGCAGGGTGCAGCCTTCAGCCCAGAGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGCCCATCGGGGGCTATACCGAGACGCAGCCACACGTGGCCGTCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110411 AGCCCATCGGGGGCTATACCGAGACGCAGCCACACGTGGCCGTCCGGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CCGG         GATCAGTGGGGATGAGTTTGAACTTGGAAGGAGAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110461 CCGGGTA...CAGGATCAGTGGGGATGAGTTTGAACTTGGAAGGAGAATG

   1150     .    :
   1065 GCATTATCTA
        ||||||||||
 110863 GCATTATCTA