seq1 = pF1KB8172.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KB8172/gi568815594r_89629193.tfa (gi568815594r:89629193_89935667), 306475 bp

>pF1KB8172 420
>gi568815594r:89629193_89935667 (Chr4)

(complement)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-163  (107484-107525)   100% ->
164-306  (113280-113422)   100% ->
307-390  (206391-206474)   100% ->
391-420  (209008-209037)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGTATTCATGAAAGGACTTTCAAAGGCCAAGGAGGGAGTTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGTATTCATGAAAGGACTTTCAAAGGCCAAGGAGGGAGTTGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGCTGAGAAAACCAAACAGGGTGTGGCAGAAGCAGCAGGAAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGCTGAGAAAACCAAACAGGGTGTGGCAGAAGCAGCAGGAAAGACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAGGGTGTTCTCTATGTAG         GCTCCAAAACCAAGGAGGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AAGAGGGTGTTCTCTATGTAGGTA...TAGGCTCCAAAACCAAGGAGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGTGCATGGTGTGGCAACAG         TGGCTGAGAAGACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107504 GTGGTGCATGGTGTGGCAACAGGTA...CAGTGGCTGAGAAGACCAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAAGTGACAAATGTTGGAGGAGCAGTGGTGACGGGTGTGACAGCAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113299 GCAAGTGACAAATGTTGGAGGAGCAGTGGTGACGGGTGTGACAGCAGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCAGAAGACAGTGGAGGGAGCAGGGAGCATTGCAGCAGCCACTGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113349 CCCAGAAGACAGTGGAGGGAGCAGGGAGCATTGCAGCAGCCACTGGCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCAAAAAGGACCAGTTGGGCAAG         AATGAAGAAGGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 113399 GTCAAAAAGGACCAGTTGGGCAAGGTA...TAGAATGAAGAAGGAGCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAGGAAGGAATTCTGGAAGATATGCCTGTGGATCCTGACAATGAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206408 ACAGGAAGGAATTCTGGAAGATATGCCTGTGGATCCTGACAATGAGGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGAAATGCCTTCTGAG         GAAGGGTATCAAGACTACGAACCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 206458 ATGAAATGCCTTCTGAGGTA...TAGGAAGGGTATCAAGACTACGAACCT

    450     .
    415 GAAGCC
        ||||||
 209032 GAAGCC