seq1 = pF1KB8168.tfa, 912 bp
seq2 = pF1KB8168/gi568815590r_79665191.tfa (gi568815590r:79665191_79867663), 202473 bp

>pF1KB8168 912
>gi568815590r:79665191_79867663 (Chr8)

(complement)

1-89  (100001-100089)   100% ->
90-165  (100370-100445)   100% ->
166-249  (100572-100655)   100% ->
250-331  (100932-101013)   100% ->
332-912  (101893-102473)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCGAGCTCACCCCGAGTACAGCTCCTCGGACAGCGAGCTGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCGAGCTCACCCCGAGTACAGCTCCTCGGACAGCGAGCTGGACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCATCGAGGTGGAGAAGGAGAGTGCGGACGAGAATGG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 GACCATCGAGGTGGAGAAGGAGAGTGCGGACGAGAATGGGTG...CAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTGAGTTCGGCTCTAGGTTCCATGTCCCCAACTACATCTTCCCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100372 ACTTGAGTTCGGCTCTAGGTTCCATGTCCCCAACTACATCTTCCCAGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGGCCAGAAAAAGACGGAGAGGA         ATAATTGAGAAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100422 TTGGCCAGAAAAAGACGGAGAGGAGTG...CAGATAATTGAGAAGCGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACGAGACCGGATCAATAACAGTTTGTCTGAGCTGAGAAGGCTGGTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100589 ACGAGACCGGATCAATAACAGTTTGTCTGAGCTGAGAAGGCTGGTACCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGCTTTTGAGAAGCAG         GGATCTGCTAAGCTAGAAAAAGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100639 GTGCTTTTGAGAAGCAGGTA...TAGGGATCTGCTAAGCTAGAAAAAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGATCCTGCAGATGACCGTGGATCACCTGAAAATGCTGCATACGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 GAGATCCTGCAGATGACCGTGGATCACCTGAAAATGCTGCATACGGCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGGAAAG         GTTACTTTGACGCGCACGCCCTTGCTATGGACT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101006 AGGGAAAGGTA...TAGGTTACTTTGACGCGCACGCCCTTGCTATGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATCGGAGTTTGGGATTTCGGGAATGCCTGGCAGAAGTTGCGCGTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101926 ATCGGAGTTTGGGATTTCGGGAATGCCTGGCAGAAGTTGCGCGTTATCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGCATCATTGAAGGACTAGATGCCTCTGACCCGCTTCGAGTTCGACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101976 AGCATCATTGAAGGACTAGATGCCTCTGACCCGCTTCGAGTTCGACTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTCGCATCTCAACAACTACGCTTCCCAGCGGGAAGCCGCGAGCGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102026 TTCGCATCTCAACAACTACGCTTCCCAGCGGGAAGCCGCGAGCGGCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGCGGGCCTCGGACACATTCCCTGGGGGACCGTCTTCGGACATCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102076 ACGCGGGCCTCGGACACATTCCCTGGGGGACCGTCTTCGGACATCACCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACATCGCGCACCCGCTGTTGCTGCCCCAGAACGGCCACGGGAACGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102126 CACATCGCGCACCCGCTGTTGCTGCCCCAGAACGGCCACGGGAACGCGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCACGGCCTCACCCACGGAACCGCACCACCAGGGCAGGCTGGGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 CACCACGGCCTCACCCACGGAACCGCACCACCAGGGCAGGCTGGGCTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CACATCCGGAGGCGCCTGCTTTGCGAGCGCCCCCTAGCGGCAGCCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102226 CACATCCGGAGGCGCCTGCTTTGCGAGCGCCCCCTAGCGGCAGCCTCGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCGGTGCTCCCTGTGGTCACCTCCGCCTCCAAACTGTCGCCGCCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102276 CCGGTGCTCCCTGTGGTCACCTCCGCCTCCAAACTGTCGCCGCCTCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCCTCAGTGGCCTCCCTGTCGGTCTTCCCCTTCTCTTTCGGCTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 102326 CTCCTCAGTGGCCTCCCTGTCGGCCTTCCCCTTCTCTTTCGGCTCCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACTTACTGTCTCCCAATGCACTGAGCCCTTCAGCACCCACGCAGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102376 ACTTACTGTCTCCCAATGCACTGAGCCCTTCAGCACCCACGCAGGCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    865 AACCTTGGCAAGCCCTATAGACCTTGGGGGACGGAGATCGGAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 AACCTTGGCAAGCCCTATAGACCTTGGGGGACGGAGATCGGAGCTTTT